数据集概述
本数据集为鼠疫媒介跳蚤Oropsylla silantiewi的转录组资源,包含原始转录组序列数据、47882条组装unigene、功能注释及13052个推导开放阅读框(ORF),支撑对该跳蚤分子特征与鼠疫传播机制的研究。
文件详解
- README_for_flea.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明压缩包内文件内容,包括flea_unigene.fas(转录组组装unigene)、flea.cds(TransDecoder推导编码序列)、flea.pep(TransDecoder推导肽序列)、flea_annotation.xlsx(NR/SPROT/TREMBL/GO/COG/KEGG数据库的unigene功能注释)
- flea.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,包含上述四个核心文件(fasta格式序列文件与xlsx格式注释文件)
数据来源
Genomic Resources Notes期刊文章“Transcriptome resources for the marmot flea and plague vector, Oropsylla silantiewi”
适用场景
- 鼠疫媒介分子机制研究:分析Oropsylla silantiewi转录组特征,探究其作为鼠疫传播载体的分子基础
- 跳蚤功能基因组学分析:利用unigene注释数据研究跳蚤基因功能与代谢通路
- 病原-媒介互作研究:通过转录组数据挖掘跳蚤与鼠疫杆菌互作相关基因
- 昆虫分子标记开发:基于转录组序列开发跳蚤种群遗传分析的分子标记
- 传染病防控靶点筛选:识别跳蚤关键基因,为鼠疫传播阻断策略提供靶点参考