数据集概述
本数据集围绕测序读长、质量和数量对微卫星发现及引物开发的影响展开，对比PacBio与Illumina等测序平台的性能，包含3个植物物种的模拟与实验数据，涉及测序质量控制、微卫星标记验证等流程，共4个文件。
文件详解
- ErrorTrimSim.fastq
- 文件格式：FASTQ
- 字段映射介绍：包含经错误修剪模拟后的测序读长数据，用于评估质量控制对微卫星发现的影响。
- ReadLengthSim_noErrors.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：无错误条件下不同读长的模拟数据压缩包，用于分析读长对微卫星开发的影响。
- ReadLengthSim_withErrors.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：含错误条件下不同读长的模拟数据压缩包，用于评估读长与测序错误的交互作用。
- SeqErrorSim.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：测序错误率模拟数据压缩包，用于量化错误率对微卫星标记开发的影响。
数据来源
论文“The effects of read length, quality and quantity on microsatellite discovery and primer development: from Illumina to PacBio”
适用场景
- 分子生态学研究：用于分析不同测序平台对微卫星标记开发的影响，优化标记开发策略。
- 植物遗传学研究：为植物物种的微卫星标记开发提供技术参考和数据支持。
- 测序技术性能评估：对比PacBio与Illumina等平台在微卫星发现中的优势与不足。
- 生物信息学方法优化：基于模拟数据改进测序质量控制和微卫星检测算法。
- 引物开发效率提升：通过模拟数据指导实验设计，提高微卫星引物的转化率。
