数据集概述
本数据集包含罕见胚系变异与胰腺导管腺癌(PDAC)风险关联的基因水平分析结果,基于PanScan-PanC4(14,254样本)和UK Biobank(11,021样本)的基因型数据,涵盖注释加权与未加权两种分析方法的结果,识别与PDAC风险显著相关的基因。
文件详解
- 文件名称:MAGMA_RV_results.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含注释未加权分析(MAGMA工具计算SKAT值、固定效应meta分析结果、Bonferroni校正显著性)和注释加权分析(11种功能评分加权、ACAT方法聚合p值、meta分析结果)的基因水平结果,记录基因关联PDAC风险的统计指标。
数据来源
Pancreatic Cancer Cohort Consortium (PanScan-PanC4)、UK Biobank
适用场景
- PDAC遗传机制研究:分析罕见胚系变异对胰腺导管腺癌风险的影响及关键风险基因。
- 基因功能注释应用:评估注释加权方法在罕见变异关联分析中的效果。
- 肿瘤遗传学数据集整合:作为PDAC遗传研究的参考数据集,支持多队列meta分析验证。
- 精准医疗靶点筛选:识别PDAC风险相关基因,为早期筛查和靶向治疗提供依据。