数据集概述
本数据集记录凤蝶属(Papilio glaucus与Papilio canadensis)杂交带的基因组与地理分化模式,基于28,417个ddRAD SNPs扫描结果,识别受选择基因组区域,分析其与气候梯度相关的地理分布,探究生殖隔离的遗传机制及内外选择压力的相互作用。
文件详解
- 说明文档类(.txt)
- 文件名称:README.txt、README_for_Associated Metadata.txt、Scripts_for_SNP_filtering_and_analysis.txt、Scripts_for_processing_reads.txt
- 文件格式:TXT
- 内容介绍:包含数据集基本信息、元数据说明、SNP过滤分析脚本、测序 reads 处理脚本等
- 元数据文件(.xlsx)
- 文件名称:Associated Metadata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容介绍:杂交带样本相关的元数据信息
- 代码压缩包(.zip)
- 文件名称:Rscripts_and_associated_files.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容介绍:包含R分析脚本及相关关联文件
数据来源
Ryan et al. (2017) Patterns of divergence across the geographic and genomic landscape of a butterfly hybrid zone associated with a climatic gradient
适用场景
- 物种形成机制研究:分析杂交带基因组分化与生殖隔离的关系
- 气候适应性进化分析:探究气候梯度对蝴蝶杂交带地理分布的影响
- 基因组选择区域识别:基于SNP数据筛选受选择的功能基因区域
- 生殖隔离遗传架构解析:研究内外选择压力对生殖隔离的协同作用
- 生物信息学方法应用:参考ddRADseq数据处理及SNP分析的脚本流程