数据集概述
本数据集围绕加州湾佩斯adero盆地深海热泉中Ostiactis pearseae海葵与化能合成细菌的共生关系展开,包含海葵组织同位素分析、细菌群落分子数据、基因序列及采样记录,揭示刺胞动物首例兼性化能合成共生机制,涉及5个关联文件。
文件详解
- 文件名称:SUP05_16S_napA_aprA_copy.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含SUP05相关细菌的16S rRNA、napA、aprA基因序列数据,如>SO193-R2_complete16S开头的基因序列片段
- 文件名称:Goffredi_DataFIle_1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测为海葵组织同位素(碳、氮、硫)分析或细菌群落统计相关的结构化数据文件
- 文件名称:Ostiactis_12S_16S_18S_COIII_alignment.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含Ostiactis pearseae海葵的12S、16S、18S核糖体RNA及COIII基因的序列比对数据
- 文件名称:Ostiactis_12S_16S_18S_COIII_sequences.TXT
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Ostiactis pearseae海葵的12S、16S、18S、COIII基因的原始序列数据
- 文件名称:Sampling_anemones_Goffredi.mp4
- 文件格式:MP4
- 字段映射介绍:推测为海葵采样过程的视频记录文件
数据来源
论文“Facultative chemosynthesis in a deep-sea anemone from hydrothermal vents in the Pescadero Basin, Gulf of California”
适用场景
- 深海共生生态研究: 分析Ostiactis pearseae海葵与SUP05细菌的特异性共生关系及营养交换机制
- 化能合成代谢分析: 通过基因序列数据研究SUP05细菌的硫循环相关代谢途径(napA、aprA基因功能)
- 刺胞动物进化研究: 基于首例兼性化能合成共生数据,探究刺胞动物生态适应策略的进化
- 深海热泉生态监测: 结合采样记录分析热泉环境下海葵与共生菌的分布及丰度特征