数据集概述
本数据集基于景观基因组学方法,对覆盖墨西哥至阿根廷10000公里分布范围的246份野生菜豆(Phaseolus vulgaris)材料进行约20K SNP基因分型,通过离群位点检测和生物气候变量关联分析,识别环境适应相关候选基因,为菜豆遗传改良提供分子标记资源。
文件详解
- 文件名称:Haplotype blocks.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含野生菜豆基因组中的单倍型块信息,用于分析群体遗传结构与环境适应的关联
- 文件名称:Vcf.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含约20K SNP的变异数据(VCF格式),记录246份野生菜豆材料的基因型信息,用于群体遗传分化和环境关联分析
数据来源
论文“Signatures of Environmental Adaptation During Range Expansion of Wild Common Bean (Phaseolus vulgaris)”
适用场景
- 植物环境适应机制研究:分析野生菜豆在温度、降水等环境变量下的遗传适应特征
- 作物遗传改良:挖掘环境适应相关候选基因,开发分子标记用于菜豆抗逆育种
- 群体基因组学分析:通过SNP数据研究野生菜豆的迁移路线、种群分化及遗传多样性
- 景观基因组学方法验证:验证离群位点检测与生物气候变量关联分析在植物适应研究中的应用效果