数据集概述
本数据集为鳍条鱼（Actinopterygii）分子分歧时间研究的相关数据，包含4个.tre文件和4个.xml文件，共8个文件。数据用于分析系统发育信息对分子分歧时间估计的影响，解决线粒体与核基因序列年龄估计的不一致问题，通过排除饱和数据调和分歧时间估计结果。
文件详解
- .tre文件（共4个，文件格式：TRE）
- 文件名称：ALLalignwithcichlidcali_MTDNA.tre、All_calisNuc_All.tre、All_calisNuc_7Part.tre、Prunedalignwithcichlidcali_MTDNA.tre
- 字段映射介绍：包含鳍条鱼分子系统发育树信息，记录不同序列（线粒体、核基因）及不同处理方式下的系统发育关系与分歧时间相关结构
- .xml文件（共4个，文件格式：XML）
- 文件名称：xmlDornburg_pruned_nDNA.xml、xmlDornburg_all_mt.xml、xmlDornburg_allnuc.xml、xmlDornburgPruned_ALLmt.xml
- 字段映射介绍：包含分子钟分析的参数配置与元数据，记录校准策略、分子钟模型等分析设置信息
数据来源
论文“Phylogenetic informativeness reconciles ray-finned fish molecular divergence times”
适用场景
- 鱼类分子系统发育研究：分析鳍条鱼线粒体与核基因序列的系统发育关系及分歧时间估计
- 分子分歧时间校准优化：研究系统发育信息对分歧时间估计的影响，优化校准策略
- 核苷酸替代饱和分析：通过数据排除方法解决核苷酸替代饱和导致的分歧时间估计不一致问题
- 分子钟模型评估：比较不同分子钟模型在鱼类分歧时间估计中的应用效果
