数据集概述
本数据集为地中海广泛分布的树种地中海松（Pinus halepensis Mill.）的转录组研究数据，包含转录组组装结果、功能注释及分子标记开发信息，用于解析该物种对干旱和火灾的适应分子机制，助力群体基因组学与关联遗传学研究。
文件详解
- 文件名称：Pinus halepensis__KEGG_annotation.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含地中海松转录组的KEGG功能注释信息，可能涵盖基因对应的KEGG通路、酶编号、功能描述等字段。
- 文件名称：Phalepensis_GO_annotation.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含地中海松转录组的GO功能注释信息，可能涵盖基因对应的GO分类（生物过程、分子功能、细胞组分）及注释描述等字段。
- 文件名称：Pinus halepensis_transcriptome.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含地中海松转录组的组装序列，每条序列以ID开头，后续为核苷酸序列。
数据来源
论文“First insights into the transcriptome and development of new genomic tools of a widespread circum-Mediterranean tree species, Pinus halepensis Mill.”
适用场景
- 植物分子适应性研究: 分析地中海松对干旱、火灾等环境胁迫的分子响应机制。
- 转录组功能注释分析: 利用KEGG、GO注释数据研究基因功能分类与代谢通路。
- 分子标记开发应用: 基于SSR和SNP标记数据开展群体遗传多样性与关联分析。
- 非模式植物基因组学研究: 为大基因组非模式植物的转录组研究提供方法参考。
