数据集概述
本数据集包含130科被子植物的序列分析数据,探究基因组突变率、种群替代率、谱系分化率间的关联,验证分子进化速率与物种多样性的关系,分析线粒体、叶绿体、核基因组同义替代率与植物性状(高度、基因组大小)的相关性,以及替代率与物种丰富度的关联。
文件详解
- README_for_PlantRateEstimation.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集补充说明文档,包含文件结构说明、用于PAML软件的Unix分析脚本说明,关联论文作者及期刊信息
- PlantRateEstimation.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,包含与开花植物突变率、替代率及物种多样性分析相关的原始数据或分析文件(具体内容需解压后查看)
数据来源
论文“Exploring the relationships between mutation rates, life history, genome size, environment and species richness in flowering plants”(American Naturalist, 2014)
适用场景
- 植物分子进化研究: 分析不同基因组(线粒体、叶绿体、核)的同义/非同义替代率与植物性状的关联
- 物种多样性驱动因素分析: 验证分子进化速率与开花植物物种丰富度的相关性
- 进化生物学假说验证: 评估突变率、替代率与谱系分化率间相互作用的竞争假说
- 生物信息学分析方法应用: 基于PAML软件的植物分子进化速率估计流程复现与优化
- 植物性状与基因组进化关联研究: 探究植物高度、基因组大小等性状对突变率的影响机制