Plasmodium_falciparum_New_World殖民化_抗原选择模式研究数据

数据集概述

本数据集围绕恶性疟原虫在新大陆殖民后红细胞结合抗原(eba基因)的选择模式展开,包含3个eba基因、2个管家基因的序列数据及272个SNP数据集、补充表格,共7个文件。通过对比南美与非洲种群的基因多态性,分析eba基因在新宿主环境下的选择压力差异,为疟原虫进化研究提供基础数据。

文件详解

  • 基因序列文件(.fas格式,共5个)
  • 文件名称:eba140_sequences.faseba175_sequences.faseba181_sequences.fasadsl_sequences.fasserca_sequences.fas
  • 内容说明:分别包含恶性疟原虫eba-140、eba-175、eba-181红细胞结合抗原基因及adsl、serca管家基因的核苷酸序列数据
  • SNP数据集文件(.xls格式)
  • 文件名称:272 SNP dataset_South America_Yalcindag.xls
  • 内容说明:包含南美恶性疟原虫种群的272个单核苷酸多态性(SNP)数据
  • 补充表格文件(.xlsx格式)
  • 文件名称:Supp table 1 Yalcindag et al.xlsx
  • 内容说明:研究相关的补充表格数据,支持基因选择压力分析的辅助信息

数据来源

论文“Patterns of selection on Plasmodium falciparum erythrocyte binding antigens after the colonisation of the New World”

适用场景

  • 疟原虫进化研究:分析恶性疟原虫在新大陆殖民后抗原基因的适应性进化机制
  • 抗原选择压力分析:对比南美与非洲种群eba基因的选择模式差异,探究新宿主环境对疟原虫的选择压力
  • 基因多态性研究:利用SNP数据及基因序列,研究恶性疟原虫种群的遗传多样性与分化
  • 疟原虫入侵机制研究:通过eba基因序列分析,探索疟原虫红细胞入侵相关蛋白的变异与功能适应性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.42 MiB
最后更新 2026年1月17日
创建于 2026年1月17日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。