Positive_selection_Plasmodium_falciparum宿主特异性结合进化分析数据

数据集概述

本数据集围绕恶性疟原虫(P. falciparum)RH5蛋白与人类Basigin受体的物种特异性结合机制展开,分析相关基因的阳性选择进化。涵盖疟原虫配体及宿主受体的进化选择分析,解释宿主转移及恶性疟原虫成为人类病原体的分子机制,包含3个相关文件。

文件详解

  • 文件名称:trees
  • 文件格式:无扩展名
  • 字段映射介绍:未明确说明具体字段,推测包含用于进化分析的系统发育树数据
  • 文件名称:alignments.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含BSG(phylip格式)的序列比对数据,涉及蛛猴、橄榄狒狒等物种的基因序列,用于进化选择分析
  • 文件名称:gammaMap_input_files.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包文件,推测包含用于GammaMap分析的输入文件,支持阳性选择位点的检测分析

适用场景

  • 疟原虫进化研究:分析恶性疟原虫宿主特异性结合的进化机制,探究宿主转移的分子驱动因素
  • 寄生虫-宿主互作分析:研究疟原虫配体(PfRH5、PfEBA175)与宿主受体(BSG、GYPA)的相互作用进化
  • 分子流行病学研究:为恶性疟原虫作为人类病原体的起源提供进化解释,支持相关防控策略制定
  • 生物信息学分析:利用序列比对、系统发育树及选择压力分析数据,开展相关生物信息学算法验证与应用
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.1 MiB
最后更新 2025年12月31日
创建于 2025年12月31日
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