数据集概述
本数据集围绕恶性疟原虫(P. falciparum)RH5蛋白与人类Basigin受体的物种特异性结合机制展开,分析相关基因的阳性选择进化。涵盖疟原虫配体及宿主受体的进化选择分析,解释宿主转移及恶性疟原虫成为人类病原体的分子机制,包含3个相关文件。
文件详解
- 文件名称:trees
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:未明确说明具体字段,推测包含用于进化分析的系统发育树数据
- 文件名称:alignments.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含BSG(phylip格式)的序列比对数据,涉及蛛猴、橄榄狒狒等物种的基因序列,用于进化选择分析
- 文件名称:gammaMap_input_files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,推测包含用于GammaMap分析的输入文件,支持阳性选择位点的检测分析
适用场景
- 疟原虫进化研究:分析恶性疟原虫宿主特异性结合的进化机制,探究宿主转移的分子驱动因素
- 寄生虫-宿主互作分析:研究疟原虫配体(PfRH5、PfEBA175)与宿主受体(BSG、GYPA)的相互作用进化
- 分子流行病学研究:为恶性疟原虫作为人类病原体的起源提供进化解释,支持相关防控策略制定
- 生物信息学分析:利用序列比对、系统发育树及选择压力分析数据,开展相关生物信息学算法验证与应用