数据集概述
本数据集聚焦新西兰淡水螺Potamopyrgus antipodarum,通过核单核苷酸多态性(SNP)标记和线粒体基因,分析其有性与无性谱系的核质基因组不一致性,探究无性谱系起源时间、生态进化过程对繁殖方式演化的影响,包含3个相关文件。
文件详解
- 文件名称:README_for_SNPgen_ploidy_hapl.doc
- 文件格式:DOC
- 字段映射介绍:SNPgen_ploidy_hapl数据的说明文档,包含数据背景、处理方法等相关信息。
- 文件名称:P_antipodarum_cytb_unique_haplotypes_outgroup.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:淡水螺Potamopyrgus antipodarum细胞色素b(cytb)基因的独特单倍型及外类群序列数据。
- 文件名称:SNPgen_ploidy_hapl.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含核单核苷酸多态性(SNP)标记、倍性及单倍型相关数据的表格文件。
数据来源
标题为“Data from: Discordance between nuclear and mitochondrial genomes in sexual and asexual lineages of the freshwater snail Potamopyrgus antipodarum”的研究数据
适用场景
- 进化生物学研究: 分析淡水螺有性与无性谱系的核质基因组不一致性,探究无性谱系起源及演化机制。
- 基因组学分析: 利用SNP标记和线粒体基因数据,开展种群遗传结构、单倍型分布等研究。
- 繁殖方式演化研究: 结合核质基因组数据,探讨生态和进化过程对有性与无性繁殖方式维持的影响。
- 选择与遗传漂变作用分析: 通过单倍型频率与核遗传多样性的关联,研究选择和遗传漂变在基因组演化中的作用。