数据集概述
本数据集是温带湖泊纤毛虫群落古重建生态变化研究的补充数据,包含PR2数据库的 curated 版本相关文件,用于高通量测序(HTS)数据的分类学分配,支持湖泊生态系统长期变化的研究。
文件详解
- pr2_database_curation_procedure.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:记录PR2数据库 curated 版本的关键制备步骤文档。
- pr2_version_4.12.0_18S_cil_cur.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含PR2数据库 curated 版本的DNA序列文件,满足Mothur软件对HTS数据进行分类学分配的格式要求。
- pr2_version_4.12.0_18S_cil_cur.tax
- 文件格式:TAX
- 字段映射介绍:包含PR2数据库 curated 版本DNA序列相关的分类学信息文件,满足Mothur软件对HTS数据进行分类学分配的格式要求。
数据来源
论文“Paleoreconstructions of ciliate communities reveal long‑term ecological changes in temperate lakes”及“Changes in ciliate communities reveal modification of lake ecosystem functioning over the last century”
适用场景
- 湖泊生态系统长期变化研究:用于分析温带湖泊纤毛虫群落的古重建数据,揭示生态系统的长期变化趋势。
- 高通量测序数据分类学分析:利用curated的PR2数据库文件,支持HTS数据的分类学分配工作。
- 淡水生态环境监测:为温带湖泊生态环境的监测和评估提供数据支持。
- 微生物群落研究:辅助开展湖泊纤毛虫等微生物群落的多样性及动态变化研究。