数据集概述
本数据集基于牧场集约化对溪流广食性捕食者摄食互作影响的研究,通过下一代测序技术分析近400个捕食性无脊椎动物个体的肠道内容物,探究土地利用强度梯度下捕食者食性变化。数据包含6个文件,涵盖猎物丰度、测序标签分配、基因序列、位点理化特征等信息,为研究人为干扰对溪流群落的影响提供支撑。
文件详解
- Allpreyabundance.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Site(位点)、Season(季节)、Predator(捕食者)及多种猎物类群(如Amphinemura sulcicollis、Asellus aquaticus等)的丰度数据
- MID allocation.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录测序样本的分子识别标签(MID)分配信息
- Pearson et al sequences.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:存储捕食者肠道内容物的基因序列数据
- Reverse MID.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含反向分子识别标签序列(如R1 ACGCACTCGT等)
- Forward MIDs.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含正向分子识别标签序列
- Site physicochemical characteristics.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Site(位点)、Landuse Category(土地利用类型)、Improved pasture in catchment(%)(集水区改良牧场占比)、Av. Fine sediment cover(平均细泥沙覆盖度)等位点理化特征数据
数据来源
论文“The effects of pastoral intensification on the feeding interactions of generalist predators in streams”
适用场景
- 溪流生态食物网研究:分析牧场集约化对溪流捕食者-猎物互作关系的影响
- 土地利用变化生态效应评估:探究不同土地利用强度下溪流生物群落的响应
- 捕食者食性分析:基于基因序列数据解析广食性捕食者的猎物组成
- 溪流位点理化特征与生物群落关联研究:结合位点理化数据与捕食者食性数据,揭示环境因子对生物互作的调控机制
- 分子生态学技术应用:利用下一代测序技术在水生生物食性研究中的方法参考