数据集概述
本数据集包含projMCS2项目的单细胞分析结果，涵盖双细胞过滤、差异可及性基因分析及可视化内容，提供UMAP、t-SNE、热图等图表及各细胞簇标记基因数据，为单细胞研究提供支持。
文件详解
- 数据文件 (.csv):
- 标记基因文件: 如C17_MarkerGenes_2025-03-06.csv、C3_MarkerGenes_2025-03-06.csv等，包含seqnames（染色体名）、start/end（基因位置）、strand（链方向）、name（基因名）、Log2FC（对数倍变化）、FDR（错误发现率）、MeanDiff（均值差异）等字段，共25个文件。
- 聚类基因标记汇总: 04_GeneMarkers_byCluster_1-31-2024.xlsx（Excel格式）
- 可视化文件 (.pdf):
- 降维图: 04_UMAP-Sample-Clusters.pdf、04_TSNE-Sample-Clusters.pdf、04_UMAP2Harmony-Sample-Clusters.pdf等，展示样本聚类结果
- 热图: 04_GeneMarkers_Top50_Heatmap_1-25-2024.pdf，呈现前50个标记基因热图
- 代码文件 (.r):
- 04_projMCS5_MarkerGenes_2025-03-06.R: R语言脚本文件
- 演示与分析文件:
- 04_MCS2023_1-31-2024.pptx（PPT格式）
- 04_Cluster_Analysis_2024-02-12.xlsm（Excel宏文件）
适用场景
- 单细胞生物学研究: 分析细胞簇标记基因特征及表达模式
- 生物信息学分析: 验证差异可及性基因分析结果及可视化方法
- 细胞类型鉴定: 基于标记基因数据识别特定细胞类型
- 实验结果展示: 利用UMAP、t-SNE等图表呈现单细胞聚类结果
- 生物数据分析流程复现: 通过R脚本文件参考分析步骤
