数据集概述
本数据集为高山岩鹨（Prunella collaris）摩洛哥与西班牙异域种群的进化研究数据，包含基因组多态性、精子长度、形态特征等分析文件，支持种群分化时间估算、生殖性状进化速率及生殖隔离机制的研究，共11个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README.md、README._Dataset.S2.md.txt
- 文件格式：.md、.txt
- 字段映射介绍：记录数据集元数据及各子数据集（S1-S8）的用途说明，如Dataset S1对应表1和图2数据、Dataset S2对应图3数据等
- 参考基因组文件
- 文件名称：Dataset.S3.fa.gz
- 文件格式：.gz
- 字段映射介绍：高山岩鹨摩洛哥种群参考基因组草稿，用于序列比对
- 分析代码文件
- 文件名称：Dataset.S2.R
- 文件格式：.R
- 字段映射介绍：图3数据分析所用的R脚本
- SNP数据文件
- 文件名称：Dataset.S4.vcf
- 文件格式：.vcf
- 字段映射介绍：过滤后的单核苷酸多态性（SNP）数据，用于种群系统发育分析
- 分析脚本文件
- 文件名称：Dataset.S5.XML
- 文件格式：.XML
- 字段映射介绍：SNAPP系统发育分析的输入脚本
- 系统发育树文件
- 文件名称：Dataset.S6.tre、Dataset.S8.tre
- 文件格式：.tre
- 字段映射介绍：SNAPP分析得到的最大可信度物种树及相关系统发育树结果
- 序列比对文件
- 文件名称：Dataset.S7.fas
- 文件格式：.fas
- 字段映射介绍：核苷酸序列比对文件
- 表格数据文件
- 文件名称：Dataset.S1.xlsx
- 文件格式：.xlsx
- 字段映射介绍：表1和图2所用的原始及计算数据
- 性状数据文件
- 文件名称：Dataset.S2.txt
- 文件格式：.txt
- 字段映射介绍：包含物种名称、EPY、CV等字段的性状数据，用于图3分析
数据来源
论文“Rapid sperm length divergence in a polygynandrous passerine: a mechanism of cryptic speciation?”
适用场景
- 进化生物学研究：分析高山岩鹨异域种群的分化时间、生殖性状进化速率及物种形成机制
- 基因组多态性分析：利用SNP数据开展种群遗传结构与系统发育关系研究
- 生殖隔离机制探究：通过精子长度分化数据验证隐存物种形成的生殖前隔离假说
- 比较生物学分析：结合多物种性状数据（如Dataset.S2.txt）开展跨物种生殖性状进化比较
- 生物信息学方法应用：基于参考基因组、SNP文件及分析脚本复现或拓展种群基因组学分析流程
