Pseudomonas_Based_气道上皮纤毛功能与铜绿假单胞菌防御研究数据

数据集概述

本数据集包含研究“气道上皮纤毛功能在防御铜绿假单胞菌中的作用”的生物信息分析结果,涵盖基因表达原始计数和差异表达基因分析数据,共两个文件,支持呼吸道上皮细胞抗感染机制的分子层面研究。

文件详解

  • salmon.merged.gene_counts.tsv
  • 文件格式:TSV
  • 字段映射介绍:包含gene_id(基因ID)、gene_name(基因名称),以及COPD和hAO样本组的对照(ctrl)与感染(inf)处理重复样本(r1至r4)的基因表达原始计数。
  • hAO_inf_hAO_ctrl_IHWsigFCgenes.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:使用DESeq2分析得到的差异表达基因数据,包含hAO样本组感染与对照处理间的显著差异表达基因信息。

数据来源

研究“The Role of Ciliary Function in Airway Epithelial Defense against Pseudomonas aeruginosa”的生物信息分析结果

适用场景

  • 呼吸道感染分子机制研究:分析气道上皮细胞在铜绿假单胞菌感染下的基因表达变化,探究纤毛功能相关防御机制。
  • 差异表达基因功能注释:基于差异表达基因数据,挖掘与气道抗感染相关的关键基因及通路。
  • 慢性阻塞性肺疾病(COPD)感染研究:对比COPD与hAO样本的基因表达差异,分析疾病状态下的抗感染能力变化。
  • 生物信息学方法验证:参考RNA-seq分析流程(nf-core RNA-seq v3.10.1)及差异分析工具(DESeq2)的应用案例,优化同类研究的分析策略。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.46 MiB
最后更新 2026年1月20日
创建于 2026年1月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。