数据集概述
本数据集包含研究“气道上皮纤毛功能在防御铜绿假单胞菌中的作用”的生物信息分析结果,涵盖基因表达原始计数和差异表达基因分析数据,共两个文件,支持呼吸道上皮细胞抗感染机制的分子层面研究。
文件详解
- salmon.merged.gene_counts.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:包含gene_id(基因ID)、gene_name(基因名称),以及COPD和hAO样本组的对照(ctrl)与感染(inf)处理重复样本(r1至r4)的基因表达原始计数。
- hAO_inf_hAO_ctrl_IHWsigFCgenes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:使用DESeq2分析得到的差异表达基因数据,包含hAO样本组感染与对照处理间的显著差异表达基因信息。
数据来源
研究“The Role of Ciliary Function in Airway Epithelial Defense against Pseudomonas aeruginosa”的生物信息分析结果
适用场景
- 呼吸道感染分子机制研究:分析气道上皮细胞在铜绿假单胞菌感染下的基因表达变化,探究纤毛功能相关防御机制。
- 差异表达基因功能注释:基于差异表达基因数据,挖掘与气道抗感染相关的关键基因及通路。
- 慢性阻塞性肺疾病(COPD)感染研究:对比COPD与hAO样本的基因表达差异,分析疾病状态下的抗感染能力变化。
- 生物信息学方法验证:参考RNA-seq分析流程(nf-core RNA-seq v3.10.1)及差异分析工具(DESeq2)的应用案例,优化同类研究的分析策略。