普遍染色质开放元件分子机制与应用研究数据集

数据集概述

该数据集围绕普遍染色质开放元件（UCOE®）的分子机制展开，包含蛋白质与转录因子列表、生物过程富集分析结果、基因ID转换表及相关可视化图表，为理解UCOE功能及推动其生物技术应用提供数据支持。

文件详解

• 表格文件（.xlsx格式）：
• Tables_A1_A2_A3.xlsx：包含三个表格
• Table A1：ReMAP数据库提取的A2UCOE和RPS3区域蛋白质列表，按联合排名排序，含ChIP实验位点数量
• Table A2：Table A1的生物过程富集分析结果，含过程名称、基因计数、占比、P值及富集倍数
• Table A3：Table A1蛋白质名称到Enterez Gene ID的转换表
• Tables_A4_A5_A6.xlsx：包含三个表格
• Table A4：ReMAP数据库提取的转录因子列表（经JASPAR过滤），按联合排名排序，含ChIP实验位点数量
• Table A5：Table A4的生物过程富集分析结果，含过程名称、基因计数、占比、P值及富集倍数
• Table A6：Table A4蛋白质名称到Enterez Gene ID的转换表
• Tables_A7_A8_A9.xlsx：包含三个表格
• Table A7：ReMAP数据库提取的转录因子列表（经JASPAR和普适性过滤），按联合排名排序，含ChIP实验位点数量
• Table A8：Table A7的生物过程富集分析结果，含过程名称、基因计数、占比、P值及富集倍数
• Table A9：Table A7蛋白质名称到Enterez Gene ID的转换表
• 图表文件（.png格式）：
• Figure A1.png：ReMap数据库中Rps3 UCOE基因组区域的转录因子ChIP-seq峰图，含CpG岛、GC含量、UCOE序列长度及基因编码区标注

适用场景

• 分子生物学研究：分析UCOE区域的蛋白质与转录因子结合特性
• 基因组学分析：探究染色质开放元件相关的生物过程及调控机制
• 生物技术应用：为UCOE在基因编辑、细胞工程等领域的应用提供理论依据
• 生物信息学建模：基于富集分析结果构建UCOE功能预测模型