找到41个数据集

标签: GC含量

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  • 系统发育基因组学分析_有袋类科间进化关系数据

    2026年2月1日 30 199 140

    数据集概述 本数据集包含有袋类科间系统发育基因组分析的相关文件,基于1550个基因座的核苷酸序列(覆盖22个现存有袋类科中的18个),用于解决有袋类进化关系中的系统发育冲突问题,识别支持不同系统发育树的基因座簇,分析基因树变异模式,并优化分子定年结果。 文件详解 README文件...
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  • psbA基因_微生物沉降研究_海洋河口沉积物数据

    2026年2月1日 30 4 3

    数据集概述 本数据集围绕含psbA基因的蓝藻噬菌体、蓝细菌及真核生物在海洋与河口沉积物中的沉降展开,包含3个表格,记录了不同类群psbA OTU的GC含量与D1蛋白基序、珠江口及南海站位的细节与微生物丰度,以及沉积物样品中psbA克隆文库的多样性指数,为相关研究提供数据支撑。 文件详解 文件名称:Sedimentation of psbA gene-...
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  • AMAS_Based_大序列比对操作与统计计算工具数据

    2026年1月31日 30 109 66

    数据集概述 本数据集包含AMAS工具相关数据,AMAS是一款用于大型序列比对操作和统计计算的工具,适用于氨基酸和核苷酸比对,支持格式转换、序列拼接、位点提取等操作,可计算序列数量、比对长度、缺失数据比例等统计量,适用于大规模系统发育研究。 文件详解 文件名称:Suppl_alns.zip 文件格式:ZIP...
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  • Drosophila_Based_细尺度重组率遗传进化关联数据

    2026年1月29日 30 85 28

    数据集概述 本数据集包含果蝇(Drosophila persimilis)两条主要染色体细尺度重组率的遗传进化关联研究数据。通过181个SNP标记构建重组率图谱,分析局部重组率异质性、与重复元件及序列基序的关联、交叉干扰范围,以及与姊妹种重组率的相关性,探讨重组率与核苷酸多样性、GC含量的关系,支持选择模型和GC偏向基因转换模型。 文件详解...
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  • MiRNA_FFPE组织样本MicroRNA稳定性研究测序数据

    2026年1月29日 30 164 163

    数据集概述 本数据集围绕FFPE组织样本中MicroRNA(miRNA)的稳定性展开研究,对比了FFPE心脏组织与匹配冷冻组织的miRNA测序结果,分析了GC含量对miRNA稳定性的影响,包括序列长度、测序读数计数及映射率等关键指标,揭示FFPE处理对miRNA完整性的影响。 文件详解 文件名称:MiRNA Seq.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • NAR_Puchtler_Based_单分子DNA测序微滴检测原始数据

    2026年1月26日 30 113 67

    数据集概述 本数据集为论文“Single-molecule DNA sequencing of widely varying GC-content using nucleotide release, capture and detection in...
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  • DNA_barcode_Source_ITS1与ITS2比较分析数据

    2026年1月23日 30 183 116

    数据集概述 本数据集围绕ITS1与ITS2作为真核生物DNA条形码的性能比较展开,包含大规模元分析所需的数据与代码文件。研究覆盖子囊菌、担子菌等十大类真核生物,涉及85,345个序列对,从PCR扩增、测序及物种鉴别三方面评估两者的效率与特性,为DNA条形码选择提供依据。 文件详解 文件名称:README_for_Codes for Species...
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  • Genome_wide_Based_山猫抗凝剂毒物暴露基因表达研究数据

    2026年1月22日 30 19 5

    数据集概述 本数据集为山猫抗凝剂毒物暴露相关的基因组表达研究数据,包含3个Excel文件。研究通过全基因组表达分析,揭示抗凝剂灭鼠药(ARs)对加州南部山猫群体的亚致死影响,涉及异生物质代谢、内质网应激反应、上皮完整性及免疫功能相关基因的差异表达,为野生动物毒理学研究提供基因层面的证据支持。 文件详解...
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  • haloarchaea_Based_极端嗜盐古菌渗透压响应策略基因组测序数据集

    2026年1月20日 30 88 41

    数据集概述 本数据集包含59个极端嗜盐古菌高质量基因组草案及相关分析文件,结合21个已测序菌株基因组,用于研究极端嗜盐古菌应对渗透压变化的适应策略,涉及钾钠离子转运、镁氯积累机制、转录因子家族扩张及进化起源等内容,共7个文件。 文件详解 README文件...
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  • Gene_expression_Based_哺乳动物基因表达染色体异质性研究数据

    2026年1月15日 30 20 10

    数据集概述 本数据集围绕哺乳动物X染色体与常染色体的基因表达、染色体异质性及快X效应展开研究,包含6种哺乳动物的4800个直向同源基因分析结果,涉及dN/dS比值、基因表达水平、GC含量等核心指标,用于探究基因进化与染色体特性的关联。 文件详解 Table_S1.csv 文件格式:CSV...
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  • Pseudomonas_Based_六氯环己烷污染场地假单胞菌泛基因组动态分析数据

    2026年1月18日 30 43 26

    数据集概述 本数据集围绕六氯环己烷(HCH)污染场地富集的假单胞菌基因库展开,包含菌株RL的基因组测序数据及17个参考生态型的比较分析结果,结合污染场地宏基因组数据,探究假单胞菌泛基因组动态、代谢通路差异及水平基因转移机制,共含3个相关文件。 文件详解 系统发育树文件...
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  • Pseudomonas_R_tailocin_Based环境假单胞菌表达调控研究数据

    2026年1月18日 30 34 29

    数据集概述 本数据集为环境假单胞菌中R-tailocin表达调控研究的配套分析数据,包含RNA-seq、基因表达、ChIP-seq等多类型处理后数据,对应研究论文中的核心图表及补充图表,支持探究LexA样抑制子与H-NS样全局调控因子对R-tailocin表达的精细调控机制。 文件详解 转录组与表达数据文件 RNA-...
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  • Silurana_tropicalis_Based_西部爪蟾转座子基因组动态研究数据

    2026年1月18日 30 199 30

    数据集概述 本数据集围绕西部爪蟾(Silurana tropicalis)基因组中转座子(TEs)的动态展开研究,分析TEs与非TE重复序列的丰度、分布特征,及其与基因组变量的相关性,同时包含25个TE插入位点在19个野生个体中的多态性数据,揭示不同TE类群的插入频率差异及潜在影响因素。 文件详解 补充材料压缩包 文件名称:suppMat.zip...
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  • RNA_Editing_Based苔藓植物细胞器基因编辑位点与PPR蛋白关联研究数据

    2026年1月18日 30 87 57

    数据集概述 本数据集包含42种苔藓植物的细胞器基因RNA编辑位点及核编码PPR蛋白序列数据,涵盖31种非地钱类苔藓植物的128个细胞器基因中7428个RNA编辑位点,以及25059条PPR蛋白序列。数据可用于研究RNA编辑位点数量与GC含量、核PPR蛋白多样性的关联,是探索植物RNA编辑进化机制的基础数据。 文件详解 模型文件(org-nt-...
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  • multispecies_coalescent_Based_系统基因组学模型比较与验证研究数据

    2026年1月11日 30 113 88

    数据集概述 本数据集为系统基因组学模型比较研究的配套数据,包含47个跨生命树的系统基因组数据集的模型验证与比较结果,涉及替换模型、串联模型和多物种溯祖模型(MSC)的适用性评估,揭示不同模型在系统发育分析中的拟合度差异及影响因素。 文件详解 压缩文件(model_validation_data.zip)...
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  • Aas_et_al_2016_Based_真菌模拟群落ITS2区域嵌合序列形成研究数据_archive

    2026年1月3日 30 6 4

    数据集概述 本数据集为研究真菌模拟群落ITS2区域嵌合序列形成的DNA metabarcoding分析数据,通过不同复杂度的真菌模拟群落,探究PCR扩增和454测序过程中嵌合序列的形成率,评估Perseus和UCHIME两种算法的嵌合检测能力,分析嵌合形成的相关因素,包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称:Aas et al 2016.zip...
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  • Dietel_Selective_advantages_Data_from_AT含量选择性优势研究数据

    2026年1月2日 30 16 7

    数据集概述 本数据集为细胞内遗传元件AT含量选择性优势研究的实验数据,包含实验数据表格及AT/GC富集插入序列文档,共2个文件。研究通过对比AT富集与GC富集质粒对宿主细胞适应性的影响,揭示选择压力驱动细胞内遗传元件向高AT含量进化的机制。 文件详解 文件名称:Dietel et al_Data.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 中国东南部两种新二倍体水韭属物种叶绿体基因组特征表

    2025年12月25日 30 26 24

    数据集概述 该数据集为一个表格文件,展示了中国东南部发现的两种新二倍体水韭属物种(长乐水韭和余杭水韭)的完整叶绿体基因组特征,包含基因组大小、GC含量、基因数量等核心对比信息。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明: 表格包含以下对比字段: 基因组特征(Genome features)...
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  • 德国胎儿弯曲杆菌性病亚种基因组流行病学研究补充数据集

    2025年12月22日 30 125 110

    数据集概述 本数据集是《德国胎儿弯曲杆菌性病亚种基因组流行病学研究》论文的补充数据,包含基因组测序、样本信息、系统发育树及图表等多类型文件,为理解该病原菌的分子流行病学特征提供支持。 文件详解 数据概览文件: 00_Campylobacter fetus_data_overview.csv:CSV格式,提供样本基本信息的汇总概览...
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  • Xff_Temecula1菌株基因组Bakta重注释数据集

    2025年12月20日 30 164 86

    数据集概述 本数据集是使用Bakta流程对Xff菌株Temecula1(NCBI登录号GCF_000007245.1)基因组进行的重注释结果,包含基因组序列、注释信息、统计摘要等多种格式文件,为研究该菌株的基因组结构与功能提供支持。 文件详解 该数据集包含十四种不同格式的文件,具体说明如下: - 基因组序列文件: -...
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