数据集概述
本数据集围绕多倍体系统发育研究，提供了基于PacBio单分子测序技术的核基因数据生成及分析相关文件。包含实验设计、测序数据处理、结果文件等，支持多倍体类群系统发育分析，共9个文件。
文件详解
- 数据文件（.xlsx格式）
- 文件名称：barcodes_pacbio.xlsx、vouchertable_allruns.xlsx、PURC_molecularlab_tracking.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含PacBio测序的条形码信息、凭证标本表、PURC分子实验室跟踪数据等实验相关记录
- 脚本文件（.sh、.py格式）
- 文件名称：batch_run_purc.sh、merge_allRegimes_and_align.sh、extract_specific_accessions.py
- 文件格式：SH、PY
- 字段映射介绍：包含PURC流程批处理脚本、合并比对脚本、特定样本提取脚本等分析代码
- 压缩文件（.zip格式）
- 文件名称：PURCvsSanger_trees.zip、scripts_for_figures.zip、all_regimes_trees.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含PURC与Sanger测序结果的树文件、图表生成脚本、所有分析模式的树文件等结果文件
适用场景
- 多倍体系统发育研究：利用PacBio测序数据及PURC流程分析多倍体类群的系统发育关系
- 生物信息学流程开发：参考PURC流程的批处理、合并比对等脚本，优化多倍体数据处理流程
- 测序数据结果验证：通过PURC与Sanger测序结果的树文件比较，验证多倍体系统发育分析方法的准确性
- 多倍体进化模式分析：基于所有分析模式的树文件，探究多倍体进化的广泛模式
