Quercus_suber_SBML_Based基因组尺度代谢模型数据

数据集概述

本数据集为Quercus suber(栓皮栎)的基因组尺度代谢模型,采用SBML Level 3 Version 2格式存储。模型通过开源软件merlin(https://merlin-sysbio.org)重建,包含1个XML格式文件,可用于生物信息学领域的代谢网络分析与研究。

文件详解

  • 文件名称:Quercus suber.xml
  • 文件格式:XML
  • 字段映射介绍:符合SBML Level 3 Version 2标准的基因组尺度代谢模型文件,包含代谢反应、代谢物、基因关联等核心代谢网络信息,具体字段遵循SBML格式规范。

适用场景

  • 植物代谢网络研究: 分析Quercus suber的基因组尺度代谢通路结构与功能。
  • 代谢模型重建方法验证: 基于merlin软件重建流程的模型质量评估与方法优化。
  • 生物信息学工具测试: 用于SBML格式解析工具或代谢组学分析平台的功能验证。
  • 植物生理特性机制研究: 探究Quercus suber特有的代谢途径对其生长发育或环境适应性的影响。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 33.14 MiB
最后更新 2026年1月22日
创建于 2026年1月22日
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