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标签: 代谢模型

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  • 代谢率与早成鸟类生长发育中能量节约的研究数据

    2026年2月9日 30 104 35

    数据集概述 本数据集包含早熟鸟类(以鹌鹑为例)发育过程中的代谢率与生长数据,用于研究其在发育早期是否通过蛰伏(torpor)策略节约能量。数据记录了鹌鹑雏鸟的生长指标及夜间代谢率变化,验证了部分雏鸟在14-17日龄出现浅蛰伏现象,代谢率降低超40%,为早熟鸟类发育阶段的能量调节机制研究提供支撑。 文件详解 Growth.csv 文件格式:CSV...
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  • EPFL_Based大肠杆菌复杂化学品生物合成路径设计数据集

    2026年1月29日 30 53 12

    数据集概述 本数据集包含大肠杆菌生物合成70种复杂化学品的路径设计结果,涵盖相关模型与子网络信息,为生物工程领域研究提供结构化参考,支持复杂化学品生物合成路径的分析与优化。 文件详解 文件名称:EPFL.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • 代谢模型_肝癌患者生存免疫状态预测研究补充材料数据

    2026年1月31日 30 5 4

    数据集概述 本数据集为论文“Development and validation of metabolic models for predicting survival and immune status of hepatocellular carcinoma...
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  • BIGG_COBRAPY_Based通用代谢模型JSON格式及转换代码

    2026年1月26日 30 44 6

    数据集概述 本数据集提供BIGG通用代谢模型的COBRAPY JSON格式文件,同时包含用于模型转换的Jupyter Notebook文件。数据支持代谢网络模型的解析与应用,共包含两个文件,无目录层级结构。 文件详解 模型文件 文件名称:universal_model_cobrapy.json 文件格式:JSON...
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  • Quercus_suber_SBML_Based基因组尺度代谢模型数据

    2026年1月22日 30 115 11

    数据集概述 本数据集为Quercus suber(栓皮栎)的基因组尺度代谢模型,采用SBML Level 3 Version 2格式存储。模型通过开源软件merlin(https://merlin-sysbio.org)重建,包含1个XML格式文件,可用于生物信息学领域的代谢网络分析与研究。 文件详解 文件名称:Quercus suber.xml...
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  • Naya_et_al_DataSets_哺乳动物代谢与环境温度体重关系数据

    2026年1月21日 30 152 111

    数据集概述 本数据集包含458种哺乳动物(及亚种)的体重、基础代谢率(BMR)和年平均环境温度数据,用于研究环境温度与体重独立基础代谢率(残差BMR)的关系是否具有体型依赖性,分析不同体重下温度对代谢率的影响差异,为理解恒温动物代谢进化的驱动因素提供支撑。 文件详解 文件名称:Naya_et_al_DataSets.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Mosaic_Metabolic_Ageing_斑胸草雀代谢衰老纵向监测数据2021

    2026年1月18日 30 10 9

    数据集概述 本数据集记录了户外圈养斑胸草雀的代谢衰老研究数据,包含对407只个体六年的纵向监测,涉及基础代谢率(BMRm)和标准代谢率(SMRm)两项代谢性状的3213次测量,研究了代谢率随年龄的变化趋势及与环境质量、性别、寿命的关联。 文件详解 README_for_data_brigaverhulst3_2021.txt 文件格式:TXT...
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  • Combined_SupplementaryData_酿酒酵母与大肠杆菌代谢模型数据

    2026年1月18日 30 152 57

    数据集概述 本数据集包含酿酒酵母(Supplementary Data 1)和大肠杆菌(Supplementary Data 2)的组合热力学与化学计量代谢模型数据,共2个文件,用于微生物代谢研究相关分析。 文件详解 SupplementaryData1.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含酿酒酵母的组合热力学与化学计量代谢模型相关数据...
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  • 酿酒酵母基因组尺度代谢模型数据集

    2025年12月19日 30 99 13

    数据集概述 该数据集包含复现O. Oftadeh等人关于酿酒酵母基因组尺度代谢模型研究结果所需的模型与数据,模型整合了表达约束和反应热力学信息,为相关代谢研究提供基础数据支持。 文件详解...
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  • 奶牛镁_酸碱矿物质及微量元素需求建议补充材料

    2025年12月6日 30 101 0

    数据集概述 本数据集为奶牛镁、酸碱矿物质及微量元素需求建议的补充材料,包含文献筛选记录、宏量与微量元素平衡试验数据、统计代码、模型输出、尿矿物排泄预测模型、加权方法比较及乳矿物数据集等内容,为奶牛矿物质需求研究提供支撑。 文件详解 文件名称:S1 - PRISMA and Reference selected...
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  • 酿酒酵母菌株工程优化对香豆酸生产数据集

    2025年12月6日 30 178 112

    数据集概述 本数据集为论文《Kinetic-model-guided engineering of multiple S. cerevisiae strains improves p-coumaric acid...
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  • 代谢模型通量预测增强数据集

    2025年12月5日 30 125 40

    数据集概述 该数据集包含支持论文“整合相对表达与相对代谢物丰度以增强热力学一致性代谢模型通量预测”的模拟数据,覆盖转录组、代谢组、通量组数据及不同模型(含/不含热力学约束)的模拟结果,用于复现论文研究成果。 文件详解 文件名称: REMI manuscript - simData.zip 文件格式: ZIP压缩包 压缩包内目录及内容:...
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  • iCHO2441基因组尺度代谢模型数据集

    2025年11月27日 30 165 56

    数据集概述 本数据集为iCHO2441基因组尺度代谢模型的相关文件,该模型基于现有CHO细胞代谢模型扩展构建,包含分泌途径反应整合、基因表达置信度分类及约束重构等内容,为CHO细胞代谢研究提供模型支持。 文件详解 该数据集包含以下文件: - 文件名称: Supplementary material 1.docx - 文件格式: DOCX - 内容:...
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