数据集概述
该数据集包含支持论文“整合相对表达与相对代谢物丰度以增强热力学一致性代谢模型通量预测”的模拟数据，覆盖转录组、代谢组、通量组数据及不同模型（含/不含热力学约束）的模拟结果，用于复现论文研究成果。
文件详解
- 文件名称: REMI manuscript - simData.zip
- 文件格式: ZIP压缩包
- 压缩包内目录及内容:
- Expression_data: 含Ishii et al（test_expr.mat）和Holm et al的转录组学数据
- Fluxdata: 含Ishii et al和Holm et al的通量组学数据
- Metabolomics: 含上述两项研究的代谢组学数据
- ModelsSolutions: 含不同模型（TGex、TGexM、TM、Gex、GexM、M）的通量解、相关值及误差数据，按突变体/条件分类
- AlternativeMCS: 含MCS替代状态结果
- FVAMM: 含通量变异性分析结果
- Scatter_plot: 含实测与预测通量的相关性散点图
适用场景
- 代谢工程研究: 用于验证整合多组学数据的代谢模型通量预测方法
- 系统生物学分析: 探究热力学约束对代谢模型预测精度的影响
- 生物信息学方法学: 复现并扩展论文提出的通量预测增强算法
- 多组学数据整合应用: 分析转录组、代谢组数据与代谢通量的关联
