酿酒酵母菌株工程优化对香豆酸生产数据集

数据集概述

本数据集为论文《Kinetic-model-guided engineering of multiple S. cerevisiae strains improves p-coumaric acid production》的支撑数据,包含酿酒酵母稳态代谢模型数据、动力学模型验证实验数据、生长曲线时间序列数据及相关代码,用于香豆酸生产的菌株设计与验证研究。

文件详解

  • README.txt: 文档文件,说明数据集基本信息及各文件内容概述。
  • strain-design.zip: 压缩文件,可能包含菌株设计相关数据,如稳态代谢模型(steady_states.csv)、ODE非线性运行验证数据等。
  • GP_20231129_112233_OD.xlsx: Excel文件,记录酿酒酵母培养的时间序列生长数据,通过Growth Profiler 960测量,以24孔板绿色强度值(G-values)表示,每30分钟采集一次。
  • data.zip: 压缩文件,可能包含补充实验数据或模型构建相关原始数据。

数据来源

EPFL-LCSB(瑞士联邦理工学院洛桑分校生物系统工程实验室)

适用场景

  • 代谢工程研究:用于酿酒酵母代谢网络模型构建与菌株优化设计。
  • 发酵过程分析:分析香豆酸生产菌株的生长动力学及发酵性能。
  • 合成生物学应用:验证基于NOMAD算法的微生物菌株设计策略有效性。
  • 生物化工生产:为香豆酸生物合成工艺优化提供数据支持。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 308.75 MiB
最后更新 2025年12月6日
创建于 2025年12月6日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。