数据集概述
本数据集为论文“Repeated shifts out of tropical climates preceded by whole genome duplication”的配套分析数据,包含研究所需的输入数据、输出结果及分析脚本,共6个文件,涵盖转录组、叶绿体、生物气候与生活史数据库等内容,支持植物进化相关分析。
文件详解
- README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据集各部分内容,包括Angiosperms353数据集的分析输出、基因比对文件、组装序列、基因树、生活史重建脚本及模型比较结果等关键信息。
- Target_files_chloroplast_its.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,包含叶绿体ITS相关目标文件。
- Transcriptome.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,包含转录组相关数据。
- Bioclimatic_and_life_history_databases.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,包含生物气候与生活史数据库数据。
- Angiosperms353.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,包含Angiosperms353数据集的分析输出、基因比对、组装序列、基因树等内容。
- Chloroplast.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,包含叶绿体相关数据。
数据来源
论文“Repeated shifts out of tropical climates preceded by whole genome duplication”
适用场景
- 植物进化研究: 分析全基因组复制与植物迁出热带气候事件的关联。
- 生物信息学分析: 利用转录组、叶绿体数据进行基因比对、序列组装及基因树构建。
- 生物气候与生活史研究: 基于生物气候与生活史数据库,开展植物适应性进化分析。
- 进化模型验证: 通过生活史重建脚本及模型比较结果,验证植物进化相关假设。