数据集概述
本数据集包含用于分析猎蝽科（Reduvioidea）系统发育及捕食足进化的转录组与核糖体DNA数据，整合370个转录组基因位点与核糖体基因序列，构建首个高分辨率系统发育树，揭示主要类群位置及捕食足形态演化模式，共9个文件。
文件详解
- 核糖体DNA序列文件
- 文件名称：Zhang et al.Ribosomal_52taxa.phy
- 文件格式：PHY
- 内容说明：包含52个类群的核糖体DNA序列数据
- 核糖体数据分区文件
- 文件名称：Zhang et al.Ribosomal_52taxa_partition.txt
- 文件格式：TXT
- 内容说明：定义核糖体DNA序列分区（18s:1-982、28s:983-2497、16s:2498-3101）
- 基因区域说明文件
- 文件名称：Zhang et al.GeneRegions.txt
- 文件格式：TXT
- 内容说明：记录基因区域相关信息
- 转录组基因bootstrap树文件
- 文件名称：Zhang et al.370genes_BootstrapTreesForSTAR_rooted.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含370个转录组基因构建的带根bootstrap树
- 分类单元名称文件
- 文件名称：Zhang et al.TaxonNames.txt
- 文件格式：TXT
- 内容说明：记录研究涉及的分类单元名称
- 转录组与核糖体联合数据分区文件
- 文件名称：Zhang et al.TranscriptomeAndRibosomal_52taxa_partition.txt
- 文件格式：TXT
- 内容说明：定义52个类群转录组与核糖体联合数据的分区信息
- 370基因23类群分区文件
- 文件名称：Zhang et al.370genes_23taxa_partition.txt
- 文件格式：TXT
- 内容说明：定义23个类群370个转录组基因的分区信息
- 370基因23类群序列文件
- 文件名称：Zhang et al.370genes_23taxa.phy
- 文件格式：PHY
- 内容说明：包含23个类群的370个转录组基因序列数据
- 转录组与核糖体联合序列文件
- 文件名称：Zhang et al.TranscriptomeAndRibosomal_52taxa.phy
- 文件格式：PHY
- 内容说明：包含52个类群的转录组与核糖体DNA联合序列数据
数据来源
论文“Evolution of the assassin's arms: insights from a phylogeny of combined transcriptomic and ribosomal DNA data (Heteroptera: Reduvioidea)”
适用场景
- 昆虫系统发育研究: 构建猎蝽科高分辨率系统发育树，分析类群演化关系
- 捕食足形态进化分析: 结合系统发育数据研究猎蝽科捕食足形态特征的演化模式
- 基因序列分区分析: 利用分区文件进行不同基因区域（18s、28s、16s等）的进化速率比较
- 转录组与核糖体数据整合研究: 探索多基因联合分析在解决深层系统发育关系中的应用
- 生物信息学方法验证: 测试转录组与核糖体DNA联合数据在系统发育重建中的有效性
