数据集概述
本数据集聚焦澳大利亚甘蔗蟾蜍(Rhinella marina)入侵过程中的快速进化遗传机制,包含入侵前沿与长期定居区域个体的基因表达差异分析数据,涉及代谢、细胞修复等相关基因的表达变化,为研究入侵物种表型快速转变的遗传基础提供支持。
文件详解
- README_for_RSEM_expression_counts.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含样本名称(sample_name)、地理定位名称(geo_loc_name)及对应样本编号与采集地点信息(如RM0010M对应澳大利亚El Questro, WA等)
- RSEM_expression_counts.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含RSEM基因表达计数相关数据
- CaneToad_muscle_transcriptome_Australia.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:澳大利亚甘蔗蟾蜍肌肉转录组序列数据
- CaneToad_West_vs_East_noercc.edgeR.DE_results
- 文件格式:DE_RESULTS
- 字段映射介绍:甘蔗蟾蜍西部与东部群体基因差异表达分析结果(使用edgeR工具,排除rRNA基因)
数据来源
A genetic perspective on rapid evolution in cane toads (Rhinella marina)
适用场景
- 入侵物种快速进化遗传机制研究:分析甘蔗蟾蜍入侵过程中基因表达变化与表型进化的关联
- 物种入侵适应性遗传基础分析:探究代谢、细胞修复等基因在入侵前沿群体中的表达调控机制
- 进化生物学表型-基因型关联研究:结合表型数据解析基因表达差异对甘蔗蟾蜍扩散能力的影响
- 入侵生态学物种适应性评估:为预测入侵物种扩散趋势及制定防控策略提供遗传层面参考