数据集概述
本数据集围绕柔膜菌目(Leotiomycetes)的比较基因组学研究展开,包含不同物种的基因组组装信息、基因注释数据及温度适应性分析结果,以表格和图表形式呈现,为研究该类群基因在不同环境下的分布特征提供支持。
文件详解
该数据集包含9个文件,具体说明如下:
- 数据文件(.csv格式,共2个):
- Table S1.csv:包含各物种的基因组组装大小和质量数据,字段示例:Species(物种)、Genome Size (Mbp)(基因组大小)、Genome Completeness (%)(基因组完整性)等。
- Table S2.csv:包含物种的基因注释及温度适应性数据,字段示例:Species(物种)、Environment(环境)、Secreted_CAZy(分泌型CAZy基因)、Cold_Secreted_CAZy(低温分泌型CAZy基因)、Thermo_Secreted_CAZy(高温分泌型CAZy基因)等。
- 图表文件(.jpg格式,共6个):
- Figure S1. Comparative Distribution of tRNA Across Different Environments.jpg:转运RNA(tRNA)在不同环境中的比较分布图。
- Figure S2. Comparative Distribution of Aminoacids Across Different Environments.jpg:氨基酸在不同环境中的比较分布图。
- Figure S3. Comparative Distribution of P450 Genes Across Different Environments.jpg:P450基因在不同环境中的比较分布图。
- Figure S4. Comparative Distribution of Virulence Factor Genes Across Different Environments.jpg:毒力因子基因在不同环境中的比较分布图。
- Figure S6. Comparative Distribution of CAZy Genes Across Different Environments.jpg:CAZy基因在不同环境中的比较分布图。
- 文档文件(.docx格式,共1个):
- SUPP_files.docx:补充文件,可能包含研究方法、结果说明等额外信息。
适用场景
- 真菌基因组学研究:分析柔膜菌目物种的基因组特征及基因分布规律。
- 环境适应性研究:探究不同环境下植物相关基因(如CAZy、P450)的温度适应性机制。
- 比较生物学分析:对比不同环境中真菌基因(如毒力因子、tRNA)的分布差异。
- 微生物生态学研究:辅助理解真菌在不同生态环境中的生存策略与基因功能演化。