数据集概述
本数据集是RpNGS自动化平台生成的临床宏基因组病原体识别与监测数据，包含26个文件，涵盖DNA/RNA分析结果、临床热图、统计代码及补充表格等，涉及病原体分类、丰度、z值等信息，用于支持临床场景下的病原体检测与研究。
文件详解
- 核心结果文件（.rda格式，13个）
- 文件示例：idseq_nt_z_score_dna.rda、all_reports_pngsrna.rda
- 内容说明：存储DNA/RNA的z值分析结果、分类报告等结构化数据，支持R语言环境读取
- 表格数据文件（.csv格式，9个）
- 文件示例：CHRF0094_1.csv、rpngs_clinicalheatmap.csv
- 字段映射：CHRF0094_1.csv包含taxonomy_id（分类ID）、Perct（占比）、Reads（读数）、Taxa_names（分类名称）等病原体信息；rpngs_clinicalheatmap.csv包含样本与病原体的读数热力图数据
- 补充表格文件（.xlsx格式，2个）
- 文件示例：table_S1.xlsx、table_S2.xlsx
- 内容说明：研究相关的补充表格数据
- 代码文件（.r格式，1个）
- 文件名称：data_statistic.R
- 内容说明：数据统计分析的R代码脚本
- 压缩文件（.tar格式，1个）
- 文件名称：idcz_Sample_Taxo_Reports.tar
- 内容说明：样本分类报告的压缩包
数据来源
RpNGS自动化平台
适用场景
- 临床病原体检测研究：通过csv表格中的病原体分类、读数数据，分析样本中的病原体组成
- 宏基因组数据分析：利用.rda文件的z值、分类报告，研究DNA/RNA层面的病原体特征
- 临床医学统计：通过临床热力图数据，探索样本与病原体的关联模式
- 生物信息学工具验证：基于RpNGS平台输出的多类型数据，验证病原体识别算法的性能
- 医学研究补充分析：结合xlsx补充表格，支撑临床宏基因组学相关研究的结果呈现
