数据集概述
本数据集围绕奇努克与银大麻哈鱼的杂交潜力及后果展开，包含行为繁殖实验、体外受精实验结果及全转录组基因表达数据，用于分析两者间不完全的繁殖隔离机制及杂交后代的转录组响应，涉及18个相关文件。
文件详解
- 代码文件
- 文件名称：R_code_Figures_revised.txt、edgeR_code_pure_comparison.txt、Full_Model_Dom_Terms_control_for_family.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含用于生成图表、转录组分析及统计模型的R代码，涉及数据读取、模型构建等分析步骤
- 行为实验文件
- 文件名称：2014_Non_Competitive_Breeding_Experiment_Behavioural_Observations.docx、2015_Competitive_Breeding_Experiment_Behavioural_Observations.pptx
- 文件格式：DOCX、PPTX
- 字段映射介绍：记录非竞争性及竞争性繁殖实验的行为观察数据，包括实验分组、行为指标等内容
- 基因表达与GO分析文件
- 文件名称：Data_S3.Chinook_vs_coho_edgeR_results.csv、Data_S5._Enriched_overdominant_GO_terms.csv、Data_S6._Enriched_underdominant_GO_terms.csv、Figure4c.Both_crosstypes_Overdom.csv、Figure4d.Both_crosstypes_Underdom.csv、Figure_1b_data.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含edgeR差异表达分析结果、杂交后代过表达/低表达基因的GO富集分析数据，涉及GO术语、描述、富集度、P值等字段
- 序列文件
- 文件名称：Data_S1._Chinook_coho.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：奇努克与银大麻哈鱼相关基因序列数据
- 说明文件
- 文件名称：READ_ME.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集相关说明信息
数据来源
论文“Incomplete reproductive isolation and strong transcriptomic signature of hybridization between sympatric sister species of salmon”
适用场景
- 鱼类繁殖隔离机制研究：分析奇努克与银大麻哈鱼行为及配子前合子隔离的不完全性
- 杂交后代转录组响应分析：探究F1杂交后代的基因表达模式及核质不相容性机制
- 气候变化对鱼类杂交影响评估：结合繁殖时间与栖息地变化数据，预测气候变化下两者杂交的潜在趋势
- 濒危鱼类保护策略制定：为受威胁大麻哈鱼种群的保护提供杂交相关的科学依据
