数据集概述
本数据集包含欧洲沙丁鱼（Sardina pilchardus）线粒体基因组相关的测序与分析文件，涵盖139个个体的全线粒体基因组序列、13个线粒体基因序列，以及60个欧洲沙丁鱼和3个沙丁鱼属样本的12个线粒体基因序列，支持系统发育分析与进化研究。
文件详解
European_sardine_whole_mitogenome_139.fasta- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：139条欧洲沙丁鱼全线粒体基因组序列的比对结果
European_sardine_13_genes_139_IQTree.nex- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：139个欧洲沙丁鱼样本的13个线粒体基因序列比对结果
European_sardine_13_genes_139_Partitions.nex- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：用于IQtree分析的分区文件，对应上述13基因序列文件
European_sardine_12_genes_63.fasta- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：60个欧洲沙丁鱼和3个沙丁鱼属样本的12个线粒体基因序列比对结果
BEAST_infile_calibration.xml- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST分析输入文件，用于上述12基因序列文件的校准分析
数据来源
论文“Mitochondrial genomes of the European sardine (Sardina pilchardus) reveal Pliocene diversification, extensive gene flow and pervasive purifying selection”
适用场景
- 海洋生物进化研究: 分析欧洲沙丁鱼线粒体基因组的分化时间、基因流模式与选择压力
- 系统发育分析: 基于线粒体基因序列构建欧洲沙丁鱼的系统发育树
- 物种分类与鉴定: 利用线粒体基因标记区分欧洲沙丁鱼与近缘物种
- 群体遗传学研究: 探究欧洲沙丁鱼种群的遗传多样性与结构特征
