Sergestidae_虾科基因比对与系统发育树分子系统学研究数据

数据集概述

本数据集包含Sergestidae虾科的单基因与多基因比对文件及系统发育树文件,用于构建该科虾类的属级系统发育树,研究生物发光器官形态多样性的演化及属间关系。数据来自13个新属的约87个个体,涵盖线粒体基因组数据及核基因、线粒体基因的Sanger测序结果,共43个文件。

文件详解

  • 基因比对文件
  • 文件名称:如NAKalignment.fasta、cox3_alignment.fasta、cobalignment.fasta等
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:包含Sergestidae虾科不同基因(如H3、NAK、16S、COI、cox3、cob等)的序列比对数据,记录物种基因序列信息
  • 系统发育树文件
  • 文件名称:如NAKalign.fasta.treefile、cob_alignment.fasta.contree、nad4_alignment.fasta.contree等
  • 文件格式:TREEFILE、CONTREE
  • 字段映射介绍:包含基于基因比对数据构建的系统发育树结构,反映Sergestidae虾科属级分类单元的演化关系
  • 说明文档
  • 文件名称:README.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:数据集相关说明文档,提供数据背景、使用方法等信息

适用场景

  • 分子系统学研究:用于构建Sergestidae虾科的属级系统发育树,分析属间演化关系
  • 生物发光器官演化研究:通过祖先状态重建,探究该科虾类生物发光器官形态(Pesta器官、非透镜发光器、透镜发光器)的演化历程
  • 分类学修订验证:对比分子系统发育树与之前的形态学分类树,验证Sergestidae科的分类修订结果
  • 生态适应性分析:结合物种深度分布数据,研究发光器官类型与物种生境适应性的关联模式
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.64 MiB
最后更新 2026年1月27日
创建于 2026年1月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。