数据集概述
本数据集基于广域系统基因组学方法,重建现存蛇尾纲(Ophiuroidea)的高级分类系统。通过外显子捕获技术从576个物种的博物馆标本中获取基因序列,构建系统发育树,并据此修订分类体系,包含分类修订方案、系统发育树、分布数据及补充图表等13个相关文件。
文件详解
- 说明文档与分类修订:
- OphiuroidHC_DRYAD_readme_file.docx:DOCX格式,数据集说明文档
- OphiuroidHC_S7_revised_classification.docx:DOCX格式,蛇尾纲高级分类修订方案
- 系统发育树文件:
- OphiuroidHC_576taxa_trees.nex:NEX格式,576个物种的系统发育树文件
- OphiuroidHC_185taxa_RAxMLtrees.nex:NEX格式,185个物种的RAxML方法构建的系统发育树
- OphiuroidHC_185taxa_BEASTtrees.nex:NEX格式,185个物种的BEAST方法构建的系统发育树
- OphiuroidHC_576taxa_1484exon.nex:NEX格式,576个物种1484个外显子的序列矩阵
- 表格数据文件:
- OphiuroidHC_distribution_summary.xlsx:XLSX格式,蛇尾纲物种分布汇总数据
- OphiuroidHC_TableS1.xlsx:XLSX格式,补充表格S1
- OphiuroidHC_Table S2.docx:DOCX格式,补充表格S2
- 补充图表文件:
- OphiuroidHC_FigS3.pdf:PDF格式,补充图S3
- OphiuroidHC_FigS4.pdf:PDF格式,补充图S4
- OphiuroidHC_FigS5.pdf:PDF格式,补充图S5
- OphiuroidHC_FigS6.pdf:PDF格式,补充图S6
适用场景
- 海洋无脊椎动物分类学研究:用于蛇尾纲物种分类系统的修订与验证
- 系统基因组学分析:探究蛇尾纲物种的系统发育关系与演化历史
- 生物多样性研究:分析蛇尾纲物种的地理分布模式及生态适应性
- 进化生物学研究:探讨蛇尾纲主要类群的分化时间与演化驱动因素
- 博物馆标本基因组学应用:验证基于博物馆标本的外显子捕获技术可行性