噬菌体基因组中广谱和特异性抗防御基因数据集

数据集概述

该数据集围绕噬菌体基因组中的广谱和特异性抗防御基因展开,包含系统发育树、序列比对、HMM模型、结构同源性搜索代码、Foldseek序列及液体培养实验原始数据,为研究噬菌体抗防御机制提供多维度支撑。

文件详解

  • File S1.zip:压缩文件,包含162个Pbunavirus噬菌体的系统发育树数据。
  • File S2.zip:压缩文件,包含本研究中识别的单个抗防御蛋白的多序列比对数据。
  • File S3.zip:压缩文件,包含本研究中识别的单个抗防御蛋白的HMM模型文件。
  • File S4.zip:压缩文件,包含用于搜索抗防御蛋白结构同源物的代码文件。
  • File S5.zip:压缩文件,包含本研究中识别的抗防御蛋白的Foldseek 3Di序列数据。
  • File S6.xlsx:Excel文件,包含液体培养实验的原始数据。

适用场景

  • 噬菌体分子生物学研究:分析噬菌体抗防御基因的序列特征与进化关系
  • 计算生物学研究:利用HMM模型和结构同源性搜索代码挖掘抗防御蛋白功能
  • 微生物学实验验证:基于液体培养原始数据复现或扩展抗防御机制实验
  • 病毒-宿主互作研究:探究噬菌体抗防御系统对宿主防御机制的抑制策略
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.11 MiB
最后更新 2025年12月15日
创建于 2025年12月15日
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