数据集概述
该数据集是2021年由EMDataResource主办的冷冻电镜图谱配体模型挑战的完整数据，包含17个研究组提交的六十一份模型及相关文件，旨在评估近原子分辨率冷冻电镜图谱中蛋白质或蛋白质-核酸复合物结合配体建模的可靠性与可重复性。
文件详解
- 挑战说明文档：
- 2021-EMDataResource-Ligand-Challenge-web.pdf：PDF格式，包含挑战网站存档内容，涵盖新闻、概述、目标、模型评估、时间线、靶点、参与指南、问答、顾问委员会及配体图片等信息
- S1_Ligand_Challenge_Statistics_Submission_Form.pdf：PDF格式，包含整体模型统计数据与模型提交表单指南
- WrapUp_MeetingAgendaLigandChallenge.pdf：PDF格式，2021年7月26-28日总结会议议程
- 模型文件：
- T010X.zip（含T0201.zip、T0202.zip、T0203.zip等）：ZIP格式，各靶点提交的模型文件，包含mmCIF和PDB格式文件
- 元数据与评分文件：
- S2_submission_metadata.xlsx：Excel格式，所有提交模型的完整元数据集
- S3_ligandchallengescores.xlsx：Excel格式，从model-compare网站编译的挑战评分数据
- 视频文件：
- zoom_discussion_mc_results.mp4：MP4格式，2021年7月14日model-compare网站分析直播演示录像
数据来源
EMDataResource
适用场景
- 结构生物学研究：评估冷冻电镜配体建模方法的准确性与可靠性
- 计算生物学分析：比较不同建模工具在近原子分辨率图谱中的配体预测性能
- 冷冻电镜技术优化：为配体建模流程的标准化与质量控制提供数据支持
- 跨研究组方法学对比：分析不同研究团队建模策略对结果一致性的影响
