数据集概述
本数据集包含挪威斯卡格拉克海峡定鞭藻的季节性多样性与动态研究数据,通过高通量测序技术分析两年间月度采集的纳米和微微型浮游生物样本,获得约四百万条454焦磷酸测序读数,经生物信息学处理得到一百五十六个操作分类单元(OTU),记录了定鞭藻群落组成、丰度的时间变化及环境因子影响。
文件详解
- 说明文件
- 文件名称:README_for_Env_data_mec-14-1145.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:环境数据相关说明文档
- 表格文件
- 文件名称:Table_S2_Egge_et_al_2015_jeukmic.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:补充表格数据文档
- 系统发育树文件
- 文件名称:RAxML_haptophyte_284_taxa_reference_tree.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:包含二百八十四个分类单元的定鞭藻参考系统发育树
- 序列比对文件
- 文件名称:Haptophyte_ref_alignment_284tax.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:二百八十四个分类单元的定鞭藻参考序列比对数据
- OTU表文件(未子采样)
- 文件名称:MEC-14-1145-OTUtab_piconanopool_notsubsamp.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:纳米和微微型浮游生物样本的OTU丰度表(未子采样版本)
- OTU序列文件
- 文件名称:MEC-14-1145-OTUs_aligned.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:已比对的OTU序列数据
- 环境数据文件
- 文件名称:Env_data_mec-14-1145.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:环境因子数据
- OTU表文件(子采样校正版)
- 文件名称:MEC-14-1145-OTUtab_piconanopool_subsamp5553_correctversion.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:纳米和微微型浮游生物样本的OTU丰度表(子采样五千五百五十三个序列的校正版本)
数据来源
论文“Seasonal diversity and dynamics of haptophytes in the Skagerrak, Norway, explored by high-throughput sequencing”
适用场景
- 海洋浮游生物多样性研究:分析斯卡格拉克海峡定鞭藻群落的季节性变化规律与物种组成
- 环境因子关联分析:探究光照、温度等环境因素对定鞭藻群落动态的影响机制
- 海洋生态系统功能研究:评估定鞭藻在北大西洋沿岸水域生物地球化学过程中的作用
- 未培养微生物资源挖掘:基于OTU数据发现潜在的新型定鞭藻类群(如HAP-3–5分支、D/E/F分支)
- 高通量测序数据分析方法验证:利用标准化的测序数据与生物信息学流程开展方法学研究