数据集概述
本数据集为共生固氮菌苜蓿中华根瘤菌（Sinorhizobium meliloti）泛表观基因组研究的补充数据，包含3个文件，涉及基因组覆盖度、泛基因组统计及甲基化基序等信息，揭示近缘菌株DNA甲基化谱的变异特征，支持表观遗传学相关分析。
文件详解
- Supplementary Dataset S1
- 文件名称：Supplementary dataset S1 - Genome coverage GC content and mapping.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基因组覆盖度数据，以及Contigs与苜蓿中华根瘤菌1021基因组复制子的分配信息
- Supplementary Dataset S2
- 文件名称：Supplementary dataset S2 (pangenome analysis).zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含泛基因组统计摘要、核心与附属同源基因、序列比对文件及R脚本
- Supplementary Dataset S3
- 文件名称：Supplementary dataset S3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基序数量（RAW）、甲基化基序数量（METH）、甲基化基序占比（RATIO），关联功能特征（CDSid、tIG、US序列）与复制子（CHR染色体、PA质粒pSymA、PB质粒pSymB等），"other"列红色标注表示缺失数据
适用场景
- 根瘤菌表观遗传学研究：分析苜蓿中华根瘤菌近缘菌株DNA甲基化谱的变异特征
- 泛基因组数据分析：利用泛基因组统计、核心/附属同源基因信息研究菌株基因组结构
- 甲基化基序功能关联分析：探索甲基化基序与功能特征、复制子的相关性
- 共生固氮机制研究：通过表观遗传数据揭示根瘤菌共生固氮的分子调控机制
