数据集概述
本数据集包含用于人类SNAPc复合物整合建模的分段低温电镜(cryoEM)密度图和衍生高斯混合模型,涉及snRNA启动子RNA聚合酶II和III招募机制的结构研究,共10个文件。
文件详解
- 压缩包文件
- 文件名称:SNAPCfiles.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:整合的SNAPc复合物相关文件压缩包
- 低温电镜密度文件(.mrc格式,共8个)
- 文件名称:LPD_SNAP1domain2.mrc、LPD_SNAP3domain1.mrc、LPD_Wing2.mrc、SNAPc.mrc、LPD_SNAP2_SNAP4domain.mrc、LPD_SNAP1domain1.mrc等
- 文件格式:MRC
- 字段映射介绍:人类SNAPc复合物不同结构域的分段低温电镜密度图文件
- 高斯混合模型文件
- 文件名称:gmm_SNAPc_50.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含高斯混合模型参数,如数据来源文件(SNAPc.mrc)、中心数(50)、协方差类型(full)、像素大小(1.0)等建模关键信息
适用场景
- 结构生物学研究: 分析人类SNAPc复合物的三维结构特征及与RNA聚合酶的相互作用机制
- 分子建模应用: 基于低温电镜密度图和高斯混合模型开展蛋白质复合物的整合建模
- 转录调控机制研究: 探究snRNA启动子区域RNA聚合酶II和III的招募过程结构基础
- 生物信息学算法验证: 测试高斯混合模型在低温电镜数据解析中的应用效果