数据集概述
本数据集包含用于鉴定欧洲野猫、家猫及其杂交后代的SNP标记相关数据。数据围绕物种保护中关键的基因渐渗检测问题，提供了开发的诊断标记集所需的序列、微卫星、形态学、线粒体DNA、Y染色体、模拟及基因分型等多类型文件，支持对自然种群渐渗率的评估与杂交过程研究。
文件详解
- RefSamplesSequences.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容介绍：参考样本序列压缩包，包含用于开发SNP标记的简化基因组测序相关序列数据
- MicrosatelliteData.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容介绍：微卫星数据表格，记录与野猫、家猫遗传分析相关的微卫星标记信息
- MorphologyData.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容介绍：形态学数据表格，包含用于物种及杂交后代鉴定的形态特征记录
- Cat_mtDNA.fasta
- 文件格式：FASTA
- 内容介绍：猫科动物线粒体DNA序列文件，存储野猫与家猫的线粒体基因组相关序列
- Y_data.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容介绍：Y染色体数据压缩包，包含与性别相关的遗传标记数据
- SimulationFiles.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容介绍：模拟文件压缩包，包含用于验证SNP标记有效性的模拟实验相关数据
- SNPgenotypingData.xls
- 文件格式：XLS
- 内容介绍：SNP基因分型数据表格，记录48个高分化（Fst>0.8）SNP标记的基因分型结果
数据来源
论文“Development of SNP markers identifying European wildcats, domestic cats, and their admixed progeny”
适用场景
- 野生动物保护遗传分析: 检测欧洲野猫种群中的家猫基因渐渗率，评估杂交对物种保护的影响
- 杂交后代分子鉴定: 利用SNP标记区分野猫、家猫、F1代杂交及回交个体
- 进化生物学研究: 分析物种间基因流动模式与杂交进化过程
- 分子标记开发应用: 为其他近缘物种的杂交检测提供SNP标记开发的方法参考
- 遗传数据整合分析: 结合微卫星、线粒体、Y染色体数据开展多维度物种遗传研究
