数据集概述
本数据集是Wilson et al.2025研究中“snrnaseq-step5-process-dea-results”代码的测试用示例数据，用于验证单细胞核RNA测序（snRNA-seq）差异表达分析（DEA）结果的处理流程，包括识别k折交叉验证的差异表达基因（DEGs）及DEG亚群。
文件详解
- 文件名称：processed_DEG_lists_example_SUD_DEA.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩文件，包含SUD差异表达分析的处理后DEG列表示例数据
- 文件名称：human_SN_anndata__DEG_subclust_example.h5ad
- 文件格式：H5AD
- 字段映射介绍：人类黑质（SN）单细胞注释数据，包含DEG亚群分析的示例结果
- 文件名称：human_SN_anndata__example.h5ad
- 文件格式：H5AD
- 字段映射介绍：人类黑质（SN）单细胞注释数据基础示例文件
- 文件名称：sud_dea_results_example.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩文件，包含SUD差异表达分析结果的示例数据
- 文件名称：gene_ontology_data.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩文件，包含基因本体（GO）数据的示例文件
数据来源
Wilson et al. 2025（https://doi.org/10.1101/2025.02.05.636667）
适用场景
- 生物信息学代码测试: 用于验证和运行“snrnaseq-step5-process-dea-results”代码，测试差异表达基因识别及亚群分析流程
- 单细胞转录组数据分析: 基于示例h5ad文件学习人类黑质单细胞数据的处理与注释方法
- 差异表达基因研究: 利用处理后的DEG列表示例数据，探索物质使用障碍（SUD）相关的基因表达变化
- 基因本体功能分析: 通过基因本体数据示例文件，练习基因功能注释与富集分析
- 医学研究辅助: 作为HIV与SUD相关神经系统转录组研究的示例数据，辅助理解相关生物机制
