数据集概述
本数据集围绕野生狒狒的社会网络与肠道微生物组组成的关联展开,包含社会互动数据、饮食距离数据、物种丰度数据及样本信息等内容,用于研究社会关系对肠道微生物组的影响机制,涉及狒狒群体的行为、饮食及微生物组特征,共11个数据文件。
文件详解
- 样本信息文件
- 文件名称:Sample_information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录野生狒狒样本的基础信息,包含样本编号等样本相关属性
- 社会互动数据文件
- 文件名称:Mica_1yrgroom.csv、Viola_1yrgroom.csv、Mica_1yrproximity.csv、Viola_1yrproximity.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:以矩阵形式记录狒狒个体间的互动频率,如Mica_1yrgroom.csv包含M01、F07等个体编号,矩阵值代表个体间的梳理行为频率
- 饮食距离数据文件
- 文件名称:Mica_1yr_diet_BCdistance.csv、Viola_1yr_diet_BCdistance.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:记录狒狒个体间的饮食距离,如Mica_1yr_diet_BCdistance.csv包含F07、F08等个体编号,矩阵值代表饮食的 Bray-Curtis 距离
- 谱系数据文件
- 文件名称:pedigree.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:记录狒狒群体的谱系关系信息
- 微生物物种丰度数据文件
- 文件名称:Abundances_species_denovo.xlsx、Abundances_species_MetaPhlAn2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录肠道微生物的物种丰度数据,包含denovo组装和MetaPhlAn2分析得到的物种丰度结果
- 酶同源基因丰度数据文件
- 文件名称:Abundances_enzyme_orthologs.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录肠道微生物中酶同源基因的丰度数据
适用场景
- 动物行为与微生物组关联研究: 分析野生狒狒社会网络结构与肠道微生物组组成的相关性
- 微生物传播机制研究: 探究社会互动对肠道微生物在狒狒群体中传播的影响
- 饮食与微生物组关系分析: 结合饮食距离数据,研究饮食差异对肠道微生物组的作用
- 野生动物健康影响因素研究: 分析社会关系、饮食、亲缘关系等因素对野生狒狒肠道健康的综合影响
- 生物信息学分析方法应用: 用于微生物物种丰度分析、酶同源基因分析等生物信息学方法的实践与验证