数据集概述
本数据集包含高粱BTx623 EMS诱变群体的全基因组测序突变检测结果,通过复制策略降低假阳性,筛选出真实突变位点,构建了序列索引突变体数据库,涵盖高影响突变、错义突变等类型,可用于高粱功能基因组学研究与遗传改良。
文件详解
- 压缩文件集
- 文件名称:包含Supplemental_File-S1.zip、Supplemental_File-S2.zip、Supplemental_File-S5.zip、Supplemental_File-S9.zip、Supplemental_File-S14.zip、Supplemental_File-S15.zip、Supplemental_File-S19.zip、Supplemental_File-S24.zip等25个文件
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含高粱EMS诱变群体的突变位点数据、基因注释信息、突变类型统计等相关补充文件,具体字段需解压后查看原始内容
数据来源
论文“Whole genome sequence accuracy is improved by replication in a population of mutagenized sorghum”
适用场景
- 高粱功能基因组学研究: 利用高影响突变与错义突变数据,定位目标基因功能,开展正向/反向遗传学分析
- 植物诱变育种: 筛选具有优良性状的突变体,为高粱遗传改良提供材料基础
- 突变检测算法优化: 验证低深度测序下假阳性突变去除方法的有效性,优化变异检测流程
- 诱变机制研究: 分析EMS诱变位点的序列特征(如CG富集区、侧翼序列)对突变率的影响
- 比较基因组学: 与其他作物突变体数据对比,探究诱变规律的物种共性与特异性