数据集概述
本数据集为西北地中海海底峡谷及邻近斜坡区域的深海沉积物群落时空多样性监测数据,采用18S rRNA基因v7区域的真核生物标记进行宏条形码分析,包含5569个分子操作分类单元(MOTUs),主要类群为后生动物、囊泡虫和有孔虫,涉及季节和深度梯度的群落组成差异,以及DNA与RNA数据集的对比分析。
文件详解
- README_for_MOTUdataset.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含MOTUdataset.xlsx文件的内容描述,说明数据基于18S_allshorts引物的过滤结果、Illumina MiSeq测序平台生成的序列信息等背景。
- assembled seqs.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含组装后的序列数据,为MOTU的代表性序列。
- MOTUdataset.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含各样本中MOTU的出现次数、MOTU分类鉴定信息、代表性序列等字段。
- codes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:未明确具体字段,推测为与数据集相关的编码或辅助信息表。
数据来源
MAGDALENA GUARDIOLA、MARIA JESUS URIZ、PIERRE TABERLET、ERIC COISSAC等研究者
适用场景
- 深海群落时空多样性研究: 分析海底峡谷与斜坡区域、不同深度及季节的深海沉积物群落组成差异。
- 宏条形码技术应用评估: 对比DNA与RNA宏条形码数据在群落多样性监测中的效果差异。
- 深海生物分类与多样性分析: 基于MOTU分类信息研究深海后生动物、囊泡虫等类群的多样性特征。
- 深海生态管理支持: 为深海生态系统的生物多样性监测和管理提供数据参考。