数据集概述
本数据集包含支持Spotiphy工具的单细胞空间转录组分析相关数据，涉及小鼠大脑、人类乳腺组织的空间转录组数据及细胞元数据，可用于验证该工具在实现单细胞分辨率转录组成像中的应用效果。
文件详解
- 文件名称: CosMx_metadata.xlsx，格式: .xlsx，可能包含CosMx平台的实验元数据信息
- 文件名称: alleninstitute_cell_metadata.csv，格式: .csv，字段包括ID、orig.ident、nCount_RNA、nFeature_RNA、sample_name、cluster_label等细胞元数据
- 文件名称: Xenium_FAD_1.h5ad，格式: .h5ad，可能为Xenium平台的空间转录组数据
- 文件名称: MouseBrain_scRNA_immuneenrich.rds，格式: .rds，可能为小鼠大脑免疫富集的单细胞RNA数据
- 文件名称: Visium_FAD_1.rds，格式: .rds，可能为AD模型小鼠大脑的Visium空间转录组数据
- 文件名称: Visium_WT_1.rds，格式: .rds，可能为正常小鼠大脑的Visium空间转录组数据
- 文件名称: VisiumImage_FAD_1.jpg，格式: .jpg，可能为AD模型小鼠大脑的Visium成像图片
- 文件名称: VisiumImage_WT_1.jpg，格式: .jpg，可能为正常小鼠大脑的Visium成像图片
- 文件名称: CosMx_WT_1_FAD_1.rds，格式: .rds，可能为CosMx平台的正常与AD模型小鼠数据
适用场景
- 空间转录组数据分析方法验证研究
- 阿尔茨海默病小鼠模型脑区细胞亚群研究
- 正常小鼠大脑星形胶质细胞区域特异性分析
- 人类乳腺肿瘤微环境空间互作模式研究
- 单细胞空间转录组成像工具的开发与优化
