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PANDA_Based_空间转录组双解码分析复现数据
2026年1月31日 30 65 41
数据集概述 本数据集包含基于PANDA结果的分析复现数据，与论文“Dual decoding of cell types and gene expression in spatial transcriptomics with PANDA”的内容一致。数据分为模拟和应用两类场景，共9个压缩文件，用于支持空间转录组中细胞类型与基因表达双解码的分析复现。...
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造血干细胞新生多样性研究_单细胞与原位空间分析源数据
2026年1月31日 30 200 166
数据集概述 本数据集为造血干细胞新生多样性与微环境研究的源数据表格，按图表面板设独立标签页，与指定.rds文件配合脚本生成研究图表，包含单细胞及原位空间分析的核心数据，共1个文件。 文件详解 文件名称：torcq_et_al_2025_development_Source_data_table.xlsx 文件格式：XLSX...
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SSAM_lite_Based_空间转录组工具测试数据集
2026年1月30日 30 170 20
数据集概述 本数据集为SSAM-lite工具提供测试用的空间转录组数据，包含来自不同研究的样本数据。每个数据集文件夹内有mRNA位置文件、基因特征文件、细胞类型调色板文件及说明文档，覆盖小鼠脑体感皮层、人胰腺等组织的空间转录组数据，用于工具功能验证与使用演示。 文件详解 压缩包文件： 文件名称：SSAM-lite_test_data.zip...
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空间分辨转录组学_小鼠骨骼肌神经损伤空间转录组数据_发布版本1
2026年1月28日 30 135 123
数据集概述 本数据集为小鼠骨骼肌可逆神经损伤的空间转录组数据，是论文“Spatially resolved transcriptomics reveals innervation-responsive functional clusters in skeletal...
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SOAPy_Source_Python包空间架构分析配套数据集
2026年1月28日 30 131 28
数据集概述 本数据集为SOAPy（用于解析空间架构、动态和通信的Python包）文章及教程配套数据，包含五个文件，涵盖空间组学样本数据、数据来源说明及聚类结果。数据可用于空间组学分析相关研究，支持用户通过数据来源文件获取原始数据链接。 文件详解 数据来源说明文件 文件名称：data sources.xlsx 文件格式：XLSX...
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ZipSeq_Source_单细胞转录组实时空间定位技术实验数据
2026年1月28日 30 59 48
数据集概述 本数据集为ZipSeq技术相关研究数据，ZipSeq是一种通过图案化照明和光笼寡核苷酸在完整组织活细胞上连续打印条形码的空间转录组技术。数据包含12个TIFF图像文件和1个Excel元数据文件，涉及体外伤口愈合、淋巴结切片、肿瘤微环境等场景的基因表达定位实验，共13个文件。 文件详解 元数据文件 文件名称：metadata.xlsx...
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Mouse_Hippocampus_Based空间转录组研究数据集
2026年1月27日 30 82 80
数据集概述 本数据集为用于空间转录组（ST）研究的小鼠海马体数据，包含一个压缩文件，未划分训练/测试集、数据/标签集或原始/处理集，无额外目录结构，可支持小鼠海马体相关的空间转录组学分析。 文件详解 文件名称：mouse_hyppocampus_slideseqv2.zip 文件格式：ZIP...
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Spatially_Resolved_周围神经鞘瘤良恶性空间转录组学研究数据
2026年1月20日 30 162 97
数据集概述 本数据集为周围神经鞘瘤（PNSTs）良恶性空间转录组学研究数据，涵盖良性及恶性PNSTs的空间转录组信息，通过空间聚类分析、加权相关网络分析等方法构建基因表达模块，整合转录数据与组织学特征，旨在揭示PNSTs的空间异质性及生物学特性，包含2个文件。 文件详解 文件名称：Sample_list.xlsx 文件格式：XLSX...
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空间分辨的微胶质细胞表达谱_阿尔茨海默病患者组织中Aβ斑块周围基因表达数据
2026年1月21日 30 57 13
数据集概述 本数据集为论文配套的代码与预处理后数据，基于NanoString GeoMx DSP技术，分析人类阿尔茨海默病（AD）及认知正常淀粉样蛋白阳性（CU-AP）个体海马组织中，Aβ斑块接触区、 peri-plaque区及远离斑块区小胶质细胞的基因表达差异，包含跨物种（小鼠）对比数据，共14个文件。 文件详解 数据文件（CSV格式，共11个）...
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Visium_Based_成人肾上腺与肾上腺皮质腺瘤单细胞核分辨率细胞图谱数据
2026年1月19日 30 13 5
数据集概述 本数据集提供成人健康肾上腺及肾上腺皮质腺瘤（ACA）的单细胞核及空间转录组分析数据，构建完整肾上腺细胞图谱。以正常肾上腺为参考，揭示ACA肿瘤内转录组异质性，识别与皮质醇分泌及遗传背景相关的特定细胞群，支持肾上腺疾病研究。 文件详解 空间转录组重复样本文件 文件名称：NAG-7A.zip、NAG-7B.zip 文件格式：ZIP...
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largeEELproject_Based_EEL_FISH空间转录组分析数据
2026年1月19日 30 46 22
数据集概述 本数据集是largeEELproject计算资源库，包含论文项目“High-throughput spatial transcriptome profiling with EEL-FISH”相关的数据与代码文件，共15个文件，涉及坐标数据、运行时间记录、实验结果表格、分析代码等内容，用于支持EEL-...
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cartloader_Based_10X_Xenium空间转录组分析结果_PMTiles格式数据
2026年1月8日 30 21 12
数据集概述 本数据集是cartloader公开教程的一部分，基于10X Xenium小鼠数据集，展示如何使用cartloader工具包将空间转录组数据转换为Web优化的空间索引PMTiles格式，用于下游分析、交互式Web可视化和跨平台数据共享。包含SGE数据集及其FICTURE分析得到的空间因子相关文件，共69个文件。 文件详解...
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SupplementaryTables_Based_可分离空间单细胞转录组表示学习补充数据
2026年1月13日 30 92 3
数据集概述 本数据集为可分离空间单细胞转录组表示学习研究的补充表格，包含预处理数据链接、ARI指标、LR配对及Nanostring相关性等四类表格文件，支持对该研究方法相关数据的验证与分析。 文件详解 Preprocessed_data_link.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：包含预处理数据的相关链接信息 Metirc_ARI.xlsx...
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cartloader_Based_CosMX_SMI小鼠空间转录组分析及PMTiles转换结果
2026年1月11日 30 199 0
数据集概述 本数据集是cartloader公开教程的一部分，基于CosMX SMI小鼠空间转录组数据集，展示如何使用cartloader工具包将空间转录组数据转换为网络优化的空间索引PMTiles格式。包含SGE数据集及其FICTURE分析得到的空间因子相关PMTiles文件，支持下游分析、交互式网络可视化和跨平台数据共享，共69个文件。 文件详解...
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cartloader_Based_Vizgen_MERSCOPE空间转录组分析结果_PMTiles格式
2026年1月2日 30 62 39
数据集概述 本数据集是cartloader公开教程的成果，基于Vizgen MERSCOPE小鼠空间转录组数据集，展示如何使用cartloader工具包将空间转录组数据转换为网络优化的空间索引PMTiles格式，用于下游分析、交互式网络可视化和跨平台数据共享。包含69个文件，主要为PMTiles格式的空间数据文件及配套的信息、模型和配置文件。 文件详解...
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cartloader_Starter_Tutorial_SeqScope_空间转录组_PMTiles转换结果数据
2025年12月27日 30 50 34
数据集概述 本数据集为cartloader公开教程的结果数据，基于SeqScope小鼠海马体数据集生成。包含通过cartloader工具包分析、转换得到的空间转录组PMTiles文件及相关辅助文件，可支持下游分析、交互式网络可视化与跨平台数据共享，总计69个文件。 文件详解 PMTiles文件（57个） 文件格式：PMTiles...
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Xenium_GIotto_Suite_Workshop_2024_10X人类肺癌FFPE多模态分割亚群数据_zip
2025年12月27日 30 92 21
数据集概述 本数据集为10X人类肺癌FFPE数据集的亚群区域数据，包含多模态分割信息。数据项格式与原始输出保持一致，仅对图像进行处理：从ome.tif转换为tif格式，并通过空间操作与其他数据正确映射。用于GIotto Suite Workshop 2024的Xenium分析环节。 文件详解 文件名称：workshop_xenium.zip...
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Kader_Based_输卵管高级别浆液性卵巢癌前病变免疫抑制与微环境重塑研究_GeoMx标准化计数矩阵数据_2025
2025年12月27日 30 1 0
数据集概述 本数据集为论文配套的补充表格S8，包含GeoMx空间转录组技术生成的标准化计数矩阵，聚焦输卵管高级别浆液性卵巢癌前病变的免疫抑制与微环境重塑研究，支持相关分子机制分析，共1个文件。 文件详解 文件名称：Kader et al_SuppTable S8_Q3 norm_countmatrix.xlsx 文件格式：XLSX...
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空间异构体测序亚微米单细胞分辨率大脑细胞类型空间异构体变异性数据集
2025年12月23日 30 127 1
数据集概述 本数据集为Spl-IsoFind的演示数据，围绕亚微米单细胞分辨率的空间异构体测序展开，核心展示大脑细胞类型中空间异构体变异性的相关信息，为理解该技术的应用提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：data.zip 文件格式：ZIP压缩包（.zip） 内容说明：压缩包内包含Spl-IsoFind的演示数据，具体字段及内容未提供预览信息...
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Spotiphy单细胞空间转录组分析数据集
2025年12月25日 30 133 72
数据集概述 本数据集包含支持Spotiphy工具的单细胞空间转录组分析相关数据，涉及小鼠大脑、人类乳腺组织的空间转录组数据及细胞元数据，可用于验证该工具在实现单细胞分辨率转录组成像中的应用效果。 文件详解 文件名称: CosMx_metadata.xlsx，格式: .xlsx，可能包含CosMx平台的实验元数据信息 文件名称:...
