数据集概述
本数据集为SOAPy（用于解析空间架构、动态和通信的Python包）文章及教程配套数据，包含五个文件，涵盖空间组学样本数据、数据来源说明及聚类结果。数据可用于空间组学分析相关研究，支持用户通过数据来源文件获取原始数据链接。
文件详解
- 数据来源说明文件
- 文件名称：data sources.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：提供SOAPy文章及教程中所用数据的下载链接，支持用户获取原始数据源
- 空间组学样本数据文件（.h5ad格式）
- 文件名称：KIRC_5_Visium_adata.h5ad、1516761_10X_adata.h5ad、TNBC_41sample_adata.h5ad
- 文件格式：H5AD
- 字段映射介绍：存储空间转录组样本数据，包含基因表达、空间位置等组学信息
- 聚类结果文件
- 文件名称：OV_MERSCOPE_cluster.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含cell（细胞ID）、cluster（聚类类别）字段，记录细胞聚类结果，如成纤维细胞、上皮细胞等类型
数据来源
SOAPy文章及教程配套数据（具体来源可参考data sources.xlsx）
适用场景
- 空间组学数据分析：利用.h5ad格式文件开展空间架构、细胞动态及通信机制研究
- 生物信息学工具验证：基于配套数据测试SOAPy包的空间数据解析功能
- 空间转录组聚类分析：通过CSV文件探究细胞类型空间分布特征
- 组学数据来源整合：借助xlsx文件获取多类型空间组学原始数据链接，支持扩展研究
