数据集概述
本数据集为解决有鳞目爬行动物（蜥蜴和蛇）系统发育争议而构建，整合了形态学与分子数据（691个形态特征、46个基因，覆盖161种现生类群与49种化石类群）。通过综合分析明确了高级阶元关系，揭示了化石类群（如沧龙类、多齿龙类）的意外系统位置，强调了分子与化石数据结合的重要性。
文件详解
- 文档文件（TXT格式）
- 文件名称：README_for_weighted combined analyses.txt、README_for_morphological partition analyses.txt、combined-all-taxa-ML.phy.txt
- 内容说明：包含加权综合分析、形态学分区分析的说明文档，以及全类群ML分析的DNA序列数据（如示例中显示的Homo基因序列片段）
- 压缩文件（ZIP格式）
- 文件名称：weighted combined analyses.zip、morphological partition analyses.zip
- 内容说明：分别存储加权综合分析、形态学分区分析的相关数据文件
- 系统发育数据文件（NEX格式）
- 文件名称：morphology_alltaxa.nex、squamateDNA-Bayes.nex
- 内容说明：全类群形态学数据矩阵（用于系统发育分析）、有鳞目DNA数据（用于MrBayes分析）
- 系统发育数据文件（PHY格式）
- 文件名称：morphology_alltaxa_ML.phy
- 内容说明：全类群形态学数据矩阵（用于RAxML分析）
数据来源
论文“Integrated analyses resolve conflicts over squamate reptile phylogeny and reveal unexpected placements for fossil taxa”
适用场景
- 系统发育冲突解决研究：分析形态与分子数据对有鳞目高级阶元关系的影响
- 化石类群系统位置评估：探究沧龙类、多齿龙类等化石类群在现生有鳞目中的分类地位
- 分子与形态数据整合方法验证：测试综合分析在解决系统发育争议中的有效性
- 生物演化模型构建：为有鳞目爬行动物的起源、分化时间估算提供数据支持
- 古生物系统学研究：指导化石类群分类及演化历史重建的方法优化
