数据集概述
本数据集围绕大象基因组中肿瘤抑制基因TP53拷贝数扩增展开,探讨其与大象体型增大、DNA损伤应答增强及Peto悖论的关联。包含3个文件,涉及TP53基因序列及相关演化分析数据,为研究大象基因组演化机制提供基础资料。
文件详解
- TP53.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:作为XML元数据文件,可能包含TP53基因相关的结构化描述信息,如基因拷贝数、序列特征或实验注释等(具体字段需结合文件内容确认)
- TP53.nex
- 文件格式:NEX(Nexus格式)
- 字段映射介绍:通常用于存储生物序列数据及演化分析相关的格式信息,可能包含TP53基因序列比对或系统发育分析的基础数据
- TP53.phy
- 文件格式:PHY(Phylip格式)
- 字段映射介绍:常用于系统发育分析的序列格式文件,可能包含TP53基因的多序列比对数据,支持演化树构建等分析
数据来源
论文“TP53 copy number expansion is associated with the evolution of increased body size and an enhanced DNA damage response in elephants”
适用场景
- 基因组演化研究:分析TP53基因拷贝数扩增在大象体型增大及Peto悖论中的作用机制
- 肿瘤抑制基因功能研究:探讨多拷贝TP53对DNA损伤应答及细胞凋亡的调控机制
- 生物适应性演化分析:研究大象应对癌症风险的基因组适应性策略
- 系统发育分析:基于TP53基因序列数据构建大象及相关物种的演化关系