数据集概述
本数据集为亚得里亚海两侧地下端足类（Niphargus属）的生物地理研究数据，包含系统发育分析、物种界定、生物地理模型构建等相关文件，用于验证海退-海侵循环对端足类分布模式的影响，支持“扩散-隔离交互作用塑造分布”的结论，共9个文件。
文件详解
- 系统发育分析文件
BEAST_TransadriaticNiphargus_calibration.xml：XML格式，BEAST校准文件IQtree_TransadriaticNiphargus.phy：PHY格式，IQtree系统发育分析输入文件IQtree_TransadriaticNiphargus_PartitionModels.nex：NEX格式，IQtree分区模型文件MrBayes_TransadriaticNiphargus.nex：NEX格式，MrBayes系统发育分析文件- 物种界定文件
COI_species_delimitation_HAPLOTYPES.fasta：FASTA格式，COI单倍型物种界定文件COI_species_delimitation_FULL.fasta：FASTA格式，COI完整序列物种界定文件- 生物地理分析文件
BioGeoBEARS_trees.txt：TXT格式，生物地理分析树文件BioGeoBEARS_geodata.txt：TXT格式，生物地理分析地理数据文件BioGeoBEARS_timetree.nex：NEX格式，生物地理分析时间树文件
数据来源
论文“How did subterranean amphipods cross the Adriatic Sea? Phylogenetic evidence for the dispersal-vicariance interplay mediated by marine regression-transgression cycles”
适用场景
- 生物地理学研究：分析亚得里亚海地下端足类的分布模式与海退-海侵循环的关系
- 系统发育分析：利用分子数据构建Niphargus属端足类的系统发育树
- 物种界定研究：基于COI序列进行端足类物种界定
- 生物地理模型验证：通过BioGeoBEARS文件验证扩散-隔离模型对端足类分布的解释力
- 进化时间校准：使用BEAST文件分析端足类的进化时间节点
