数据集概述
本数据集是Anderson等人2025年研究的补充数据，包含Trichodesmium宏基因组序列、KEGG注释、补充表格及图表，用于分析海洋不同区域资源可用性对该生物蛋白质丰度模式的影响，支持蛋白质组学相关研究。
文件详解
- 宏基因组与注释文件：
- all_3_t_metaG.faa：FASTA格式，包含北大西洋、北太平洋、南太平洋三个区域Trichodesmium菌落宏基因组的翻译contigs
- 3_metag_kegg.txt：TXT格式，包含contigs的KEGG KO注释信息，字段示例为contig名称与KO编号映射
- 补充表格文件：
- Supplementary_Tables.xlsx：Excel格式，含7个子表，包括样本元数据、宏基因组构建信息、蛋白质谱计数与注释、标记蛋白列表等
- 补充图表文件：
- Figure_S1.pdf：PDF格式，三区域Trichodesmium蛋白质谱计数的对应分析图
- Figure_S2.pdf：PDF格式，区域水平Fe-P共胁迫信号指标图
- Figure_S3.pdf：PDF格式，P/Fe胁迫标记蛋白与NifH谱计数的相关性分析图
数据来源
ProteomeXchange Consortium（PRIDE数据库，数据集标识符PXD057942）、GitHub
适用场景
- 海洋微生物蛋白质组学研究：分析Trichodesmium蛋白质丰度与海洋资源的关联
- 宏基因组注释分析：探究Trichodesmium功能基因的KEGG通路分布
- 环境胁迫响应研究：验证Fe-P共胁迫对海洋固氮生物的分子调控机制
- 跨区域海洋生态比较：对比不同大洋区域Trichodesmium的生理适应特征
